More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2314 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  100 
 
 		 146 aa  289  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  67.35 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  63.7 
 
 		 146 aa  186  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  186  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 146 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  64.38 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  63.95 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 		 146 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 147 aa  173  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  61.38 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  61.38 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 		 146 aa  166  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  60.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  60.54 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  63.27 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  57.64 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  157  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  60.27 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  55.78 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  55.41 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  56.46 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  58.78 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  53.06 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.67 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  49.65 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  59.68 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  62.39 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  56.08 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  56.55 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 150 aa  127  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  45.39 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  51.35 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 		 173 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  51.02 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  44.08 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  45.62 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  44.08 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  48.37 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  46.36 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 155 aa  120  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0250  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>