More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2287 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 313 aa  643    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  62.3 
 
 		 315 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  63.9 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  64.45 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  59.29 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  60.52 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  59.79 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 		 303 aa  360  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  55.96 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 		 303 aa  358  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  54.4 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 		 305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 303 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  56.13 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 		 305 aa  348  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 		 303 aa  345  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 309 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 		 302 aa  341  7e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 		 355 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 300 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 302 aa  330  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 		 317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  52.75 
 
 		 323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 302 aa  322  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 		 312 aa  322  7e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 316 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 316 aa  319  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 303 aa  319  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 304 aa  318  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 		 318 aa  315  5e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 309 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 316 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 312 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  52.41 
 
 		 312 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 305 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 305 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 300 aa  308  9e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 305 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 318 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1697  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4137  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 		 306 aa  302  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  44.95 
 
 		 316 aa  301  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 		 306 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 305 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 311 aa  299  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 309 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  46.81 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  47.42 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>