275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2255 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  58.67 
 
 
227 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  58.22 
 
 
227 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  36.05 
 
 
241 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  35.78 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  38.5 
 
 
224 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  35.29 
 
 
226 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  34.51 
 
 
231 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  37.74 
 
 
223 aa  149  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  36.74 
 
 
224 aa  148  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  36.04 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  35.87 
 
 
233 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  36.49 
 
 
224 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  36.89 
 
 
235 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
242 aa  137  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  35.58 
 
 
223 aa  136  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.96 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  33.78 
 
 
237 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  32.66 
 
 
253 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  33.19 
 
 
234 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  34.1 
 
 
246 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  34.1 
 
 
246 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.52 
 
 
254 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  31.91 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30.77 
 
 
243 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  31.8 
 
 
244 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  31.72 
 
 
265 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  28.7 
 
 
235 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  31.82 
 
 
301 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  28.84 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  32.19 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.28 
 
 
261 aa  118  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  30.94 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  30.94 
 
 
292 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  29.66 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.14 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.45 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.15 
 
 
252 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  32.61 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.91 
 
 
288 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.91 
 
 
316 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  31.78 
 
 
240 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.91 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  31.53 
 
 
285 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  30.38 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.45 
 
 
295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  32.16 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30.45 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.45 
 
 
295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  44.44 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  30.45 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  29.78 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  31.14 
 
 
268 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.71 
 
 
242 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  32.23 
 
 
239 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.22 
 
 
292 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  30.94 
 
 
300 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.53 
 
 
241 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  28.83 
 
 
295 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  27.07 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  30.8 
 
 
300 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  29.74 
 
 
256 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  29.86 
 
 
235 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  27.95 
 
 
252 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  33.65 
 
 
217 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  31.49 
 
 
221 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  29.86 
 
 
235 aa  104  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.69 
 
 
245 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.91 
 
 
241 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  32.7 
 
 
232 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  32.04 
 
 
249 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  32.29 
 
 
258 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  28.91 
 
 
235 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  28.91 
 
 
235 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  28.91 
 
 
235 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  39.83 
 
 
263 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  29.91 
 
 
260 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  28.91 
 
 
235 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  31.4 
 
 
278 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  26.94 
 
 
266 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  37.59 
 
 
241 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  28.09 
 
 
308 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  30.54 
 
 
256 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  28.31 
 
 
235 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  41.28 
 
 
247 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  28.44 
 
 
235 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  28.44 
 
 
235 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  28.99 
 
 
254 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  40.74 
 
 
243 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  28.63 
 
 
239 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.96 
 
 
254 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>