176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2190 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  76.05 
 
 
522 aa  819    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  66.48 
 
 
525 aa  720    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  65.4 
 
 
520 aa  699    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  64.52 
 
 
531 aa  692    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  100 
 
 
526 aa  1091    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  55.64 
 
 
549 aa  611  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0214  hydroxylamine reductase  62.29 
 
 
531 aa  601  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.997496 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  54.84 
 
 
537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  54.84 
 
 
535 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  54.13 
 
 
539 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  53.76 
 
 
537 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  54.2 
 
 
533 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  54.2 
 
 
533 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  54.07 
 
 
533 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  52.75 
 
 
553 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  51.35 
 
 
568 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  52.86 
 
 
550 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  53.65 
 
 
533 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  54.34 
 
 
531 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  53.97 
 
 
531 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  51.27 
 
 
541 aa  555  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  51.26 
 
 
568 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  52.09 
 
 
566 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  53.27 
 
 
542 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  50.87 
 
 
565 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  52.58 
 
 
532 aa  545  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  51.18 
 
 
542 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  51 
 
 
542 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  50 
 
 
546 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
547 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  49.64 
 
 
548 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  49.01 
 
 
549 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  49.09 
 
 
544 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  47.3 
 
 
557 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  46.49 
 
 
549 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  46.99 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  48.67 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  56.31 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  48.49 
 
 
549 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  46.99 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  45.08 
 
 
555 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1905  hydroxylamine reductase  58.01 
 
 
427 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00412747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  45.85 
 
 
549 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  47.51 
 
 
538 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  46.38 
 
 
545 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  46.01 
 
 
545 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  46.59 
 
 
557 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  45.49 
 
 
547 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  45.49 
 
 
547 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  45.69 
 
 
542 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  44.86 
 
 
552 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  44.68 
 
 
554 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  45.41 
 
 
551 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  45.59 
 
 
552 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  44.58 
 
 
547 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  44.22 
 
 
540 aa  472  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  44.14 
 
 
542 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  46.33 
 
 
555 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  45.25 
 
 
553 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  45.62 
 
 
552 aa  472  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  43.62 
 
 
550 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  47.06 
 
 
541 aa  472  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  43.62 
 
 
550 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  43.62 
 
 
550 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  46.33 
 
 
555 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  45.23 
 
 
553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  46 
 
 
555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  46.29 
 
 
549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  43.61 
 
 
540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  44.98 
 
 
550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  45.04 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  43.12 
 
 
546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  44.96 
 
 
554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  44.68 
 
 
552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  44.3 
 
 
546 aa  467  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  45.44 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  46.87 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  44.62 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  44.96 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  44.36 
 
 
554 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  44.35 
 
 
554 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  44.33 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  44.62 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  44.75 
 
 
591 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  44.6 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  44.62 
 
 
550 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  44.62 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  44 
 
 
543 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  44.62 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  44.44 
 
 
550 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  44.44 
 
 
550 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  44.62 
 
 
554 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  44.44 
 
 
550 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  43.61 
 
 
539 aa  464  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  45.97 
 
 
555 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  44.44 
 
 
550 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  44.44 
 
 
550 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  44.44 
 
 
550 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  43.85 
 
 
621 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  44.44 
 
 
550 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>