41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2180 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1262    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  40.81 
 
 		 679 aa  293  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  43.84 
 
 		 709 aa  278  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  37.59 
 
 		 679 aa  263  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  37.34 
 
 		 663 aa  257  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  34.23 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  53 
 
 		 538 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  31.52 
 
 		 659 aa  170  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.35 
 
 		 533 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  27.02 
 
 		 536 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  26.22 
 
 		 495 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  26.37 
 
 		 564 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  31.25 
 
 		 567 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  27.12 
 
 		 538 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4920  Spore coat assembly protein-like protein  28.64 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  24.68 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  25.65 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  24.37 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  25 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  25 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  25 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  24.68 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  25.65 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  28.69 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  25 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  24.05 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  24.47 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  27.5 
 
 		 661 aa  77.8  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  24.37 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3062  Spore coat protein CotH  24.39 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  19.84 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  20.55 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1817  Spore coat protein CotH  27.64 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  20.91 
 
 		 610 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3453  Spore coat protein CotH  23.02 
 
 		 798 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0950404  normal  0.13091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  21.71 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  25.35 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  20.4 
 
 		 500 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3379  spore coat protein CotH  20.05 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  20.69 
 
 		 673 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  22.16 
 
 		 819 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>