More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2166 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  100 
 
 		 423 aa  828    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  65.63 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  60.24 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  60.63 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  57.68 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  58.02 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  56.06 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  52.16 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  52.94 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  52.94 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  52.94 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  52.01 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  53.35 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  51.64 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  52.47 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  52.94 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  52.71 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  52.24 
 
 		 441 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  52 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  51.76 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  52.24 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  52 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  52.24 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  52 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  52.24 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  52 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  52 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  52.24 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  52 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  52.24 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  52.01 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  51.76 
 
 		 444 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  49.76 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  50 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  47.24 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  46.36 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  47.53 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  46.88 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  49.25 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  43.93 
 
 		 440 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  49.14 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  44.52 
 
 		 437 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  44.52 
 
 		 437 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  44.68 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  44.08 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  42.92 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  44.66 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  43.33 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  43.34 
 
 		 415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  45.79 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  42.76 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  42.96 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  42.59 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  43.1 
 
 		 428 aa  317  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40.64 
 
 		 577 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  42.66 
 
 		 967 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  38.33 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  41.61 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  35.89 
 
 		 429 aa  253  6e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  38.32 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  38.28 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  36.19 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  35.28 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  36.39 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  34.56 
 
 		 424 aa  206  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  29.88 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  29.37 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  28.92 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  32.06 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  28.92 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  31.49 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  33.25 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  31.15 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  29.98 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.04 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  30.4 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  31.73 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  31.09 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  30.79 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  27.85 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  29.72 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  30.96 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  30.55 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  27.94 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  29.37 
 
 		 428 aa  139  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.83 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  29.77 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  30.22 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  28.31 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.96 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.37 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  31.28 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  31.89 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  30.94 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  30.71 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  28.57 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  27.63 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  29.41 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  29.7 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  29.81 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>