More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2157 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2157  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  100 
 
 
386 aa  800    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  46.91 
 
 
384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  37.89 
 
 
419 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  37.53 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.87 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0197  dolichyl-phosphate beta-d-mannosyltransferase  36.73 
 
 
413 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0265361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0793  putative GAF sensor protein  36.36 
 
 
521 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.31 
 
 
371 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3886  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.5 
 
 
397 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0150  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.9 
 
 
388 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.6 
 
 
376 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.49 
 
 
345 aa  189  7e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3310  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.41 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 
340 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.47 
 
 
339 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
370 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1904  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.15 
 
 
364 aa  176  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3784  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  41.67 
 
 
266 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.516121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2195  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3658  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.88 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.01 
 
 
864 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5297  putative dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.89 
 
 
377 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1800  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
377 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0148335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2295  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
376 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4305  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
386 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1007  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
407 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.034979 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26101  putative glycosyl transferase  31.15 
 
 
367 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1645  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.24 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1615  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.3 
 
 
359 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2598  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.98 
 
 
376 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.625269  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1745  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
391 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.298658  decreased coverage  0.00455743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1363  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
379 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.316632  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2707  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.66 
 
 
384 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2369  putative glycosyl transferase  30.14 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3205  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
383 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105358  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12621  hypothetical protein  31.45 
 
 
371 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.172184  hitchhiker  0.00175811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0526  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.94 
 
 
340 aa  139  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.69 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2663  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.91 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.57 
 
 
248 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  35.78 
 
 
264 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32856  predicted protein  37.29 
 
 
252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.8 
 
 
247 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  35.98 
 
 
261 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
257 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.62 
 
 
265 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.09 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  26.15 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.62 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.62 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.37 
 
 
233 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  26.25 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.87 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.07 
 
 
239 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
251 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
270 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
246 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
374 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.05 
 
 
262 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.82 
 
 
809 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.6 
 
 
257 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  34.05 
 
 
236 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  30.71 
 
 
239 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  31.82 
 
 
244 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
251 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
263 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  32.73 
 
 
883 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
242 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.87 
 
 
246 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
246 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2905  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
243 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.23 
 
 
258 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2061  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
262 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
262 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
246 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.74 
 
 
255 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2085  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
262 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
262 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
586 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.48 
 
 
255 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
246 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3418  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.25 
 
 
262 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.187526  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.82 
 
 
246 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.07 
 
 
252 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
244 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.78 
 
 
253 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0307  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.82 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  31.78 
 
 
251 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  36.74 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.24 
 
 
245 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01640  dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.88 
 
 
239 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.42 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.03 
 
 
260 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.88 
 
 
232 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.95 
 
 
241 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>