More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2148 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
292 aa  594  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  67.61 
 
 
297 aa  425  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  65.64 
 
 
293 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  64.95 
 
 
293 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  64.6 
 
 
292 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  62.54 
 
 
299 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  61.43 
 
 
293 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  60.22 
 
 
293 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  60.64 
 
 
291 aa  359  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  352  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  56.58 
 
 
299 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  351  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  351  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  56.94 
 
 
299 aa  347  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  57.65 
 
 
288 aa  343  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  56.88 
 
 
299 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  342  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  56.25 
 
 
298 aa  342  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  56.88 
 
 
299 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
298 aa  341  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  55.71 
 
 
290 aa  341  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 
287 aa  334  9e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 
287 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  56.38 
 
 
295 aa  333  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  57.93 
 
 
292 aa  332  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  54.58 
 
 
295 aa  332  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  57.86 
 
 
287 aa  331  8e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  55.09 
 
 
297 aa  331  8e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  56.58 
 
 
289 aa  329  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  56.6 
 
 
297 aa  328  7e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  54.74 
 
 
288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  56.74 
 
 
286 aa  326  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  54.32 
 
 
288 aa  319  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  52.84 
 
 
286 aa  310  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  53.66 
 
 
347 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  51.38 
 
 
292 aa  306  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  46.26 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 
307 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  40.48 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  43.68 
 
 
306 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  39.16 
 
 
309 aa  215  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  39.51 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.7 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  39.72 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  38.89 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 
308 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 
304 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  39.79 
 
 
308 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  41.22 
 
 
317 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
307 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 
312 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 
304 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  40.77 
 
 
304 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
306 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
307 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  38.52 
 
 
307 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  38.25 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
307 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  38.95 
 
 
312 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 
303 aa  205  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  37.89 
 
 
307 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 
304 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  38.43 
 
 
306 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  39.16 
 
 
307 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  40.42 
 
 
308 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  38.95 
 
 
309 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  38.11 
 
 
306 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  39.79 
 
 
307 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  39.44 
 
 
307 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 
312 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  37.72 
 
 
303 aa  202  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  37.59 
 
 
307 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  38.62 
 
 
298 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  39.51 
 
 
319 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  38.33 
 
 
307 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 
307 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  38.6 
 
 
306 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 
307 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  39.65 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>