More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2051 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  93.43 
 
 
396 aa  757    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
396 aa  792    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 
392 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  66.5 
 
 
392 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  63.96 
 
 
393 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  64.9 
 
 
393 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  62.09 
 
 
391 aa  487  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  62.6 
 
 
394 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  61.58 
 
 
393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  61.52 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  61.52 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  60.86 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  61.52 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  58.88 
 
 
392 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 
393 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  60.61 
 
 
394 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  60.81 
 
 
393 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  61.36 
 
 
393 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  59.29 
 
 
393 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 
390 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  60.31 
 
 
393 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  60.86 
 
 
394 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  60.3 
 
 
394 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  61.01 
 
 
398 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  60.3 
 
 
394 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  60.31 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  58.78 
 
 
392 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  58.63 
 
 
393 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 
395 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  61.17 
 
 
390 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  58.38 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  59.03 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  58.38 
 
 
395 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  59.8 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  59.39 
 
 
392 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  59.8 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  59.8 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  59.8 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  61.93 
 
 
392 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  58.27 
 
 
392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  58.52 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  58.63 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  58.78 
 
 
408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  59.64 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  61.58 
 
 
393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  58.02 
 
 
392 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  61.07 
 
 
393 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  59.24 
 
 
393 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 
393 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 
393 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 
393 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  58.88 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  59.54 
 
 
388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  59.64 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  59.07 
 
 
393 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  59.03 
 
 
394 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
392 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  58.88 
 
 
393 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  60.31 
 
 
393 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  60.31 
 
 
393 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 
391 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  58.78 
 
 
391 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  58.12 
 
 
392 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2086  acetyl-CoA acetyltransferase  59.54 
 
 
392 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.849145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  59.34 
 
 
391 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  58.67 
 
 
391 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  56.31 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  59.29 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  57.47 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  58.12 
 
 
392 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  58.12 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  58.38 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.57 
 
 
390 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  57.4 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  58.78 
 
 
392 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  58.52 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  58.12 
 
 
391 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  55.3 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 
392 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3171  acetyl-CoA acetyltransferase  55.58 
 
 
392 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  59.75 
 
 
393 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3352  acetyl-CoA acetyltransferase  55.58 
 
 
402 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  59.8 
 
 
393 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  59.75 
 
 
393 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  59.23 
 
 
392 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  58.38 
 
 
392 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  59.03 
 
 
392 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  54.11 
 
 
398 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>