More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2038 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  66.8 
 
 		 241 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  65.98 
 
 		 241 aa  339  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  65.98 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  66.39 
 
 		 241 aa  338  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  337  9e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  337  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 		 241 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  62.66 
 
 		 241 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 252 aa  311  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  55.19 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  52.5 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  49.37 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  48.13 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  48.46 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  46.47 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  45.83 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.96 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  44.58 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  45.96 
 
 		 414 aa  221  9e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  42.56 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  46.03 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  44.17 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  44.58 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  44.58 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  44.58 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  44.03 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  40.66 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  41.42 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  42.19 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.59 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  39.33 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  41.36 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 301 aa  181  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  39.65 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.04 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  40.57 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 369 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 312 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 287 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  39.48 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  38.2 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.57 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  40.52 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.84 
 
 		 308 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.66 
 
 		 306 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  39.37 
 
 		 328 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  38.43 
 
 		 325 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  35.44 
 
 		 272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  38.36 
 
 		 326 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  39.47 
 
 		 327 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  38.22 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  40 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.15 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.13 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  34.48 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 308 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  37.05 
 
 		 328 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.33 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.39 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  37.72 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  38.59 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0518  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  36.36 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  35.02 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  37.71 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.78 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  35.95 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 327 aa  167  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  38.01 
 
 		 305 aa  167  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  39.19 
 
 		 332 aa  168  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 356 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>