25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2006 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  31.39 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  30.91 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  31.91 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  31.18 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  32.98 
 
 
447 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  31.53 
 
 
684 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  28 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  30.3 
 
 
394 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  30.36 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  31.43 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  29.13 
 
 
373 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.67 
 
 
1150 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 
500 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  31.82 
 
 
353 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  35.37 
 
 
334 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 
522 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.13 
 
 
526 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  32.41 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 
502 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  26.12 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  26.35 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  32.81 
 
 
593 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  27.91 
 
 
333 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>