More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1991 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  100 
 
 
625 aa  1286  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  36.49 
 
 
457 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  55.75 
 
 
518 aa  203  1e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  55.29 
 
 
526 aa  197  5e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  59.65 
 
 
548 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  54.12 
 
 
1194 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  57.06 
 
 
820 aa  191  3e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  51.18 
 
 
758 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  41.08 
 
 
693 aa  144  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  45.28 
 
 
218 aa  141  4e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  44.38 
 
 
710 aa  141  4e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3479  protein of unknown function DUF1533  37.34 
 
 
428 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  41.95 
 
 
506 aa  136  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  41.14 
 
 
1226 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.38 
 
 
1821 aa  133  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  37.64 
 
 
926 aa  130  7e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  38.29 
 
 
4630 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  43.27 
 
 
1208 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  38.42 
 
 
1009 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  39.53 
 
 
531 aa  123  1e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  36.42 
 
 
920 aa  122  2e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  37.89 
 
 
629 aa  122  2e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  40.34 
 
 
223 aa  121  5e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  39.47 
 
 
685 aa  119  2e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  37.08 
 
 
660 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.40636e-07  hitchhiker  3.60107e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  41.77 
 
 
1174 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  37.08 
 
 
932 aa  117  7e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  39.55 
 
 
1847 aa  117  9e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  37.43 
 
 
631 aa  115  2e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.43 
 
 
1016 aa  116  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  38.76 
 
 
935 aa  115  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  36.75 
 
 
554 aa  113  1e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 
1321 aa  112  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  40.22 
 
 
767 aa  112  2e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  32 
 
 
573 aa  112  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  35 
 
 
921 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.37339e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  37.08 
 
 
692 aa  110  8e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  38.51 
 
 
542 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  35.75 
 
 
548 aa  109  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  36 
 
 
693 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  36.99 
 
 
624 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  33.33 
 
 
1154 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  35 
 
 
414 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  32.22 
 
 
1260 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  36.52 
 
 
1013 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  36.21 
 
 
524 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  31.98 
 
 
428 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  34.83 
 
 
506 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  36.21 
 
 
657 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.22 
 
 
1661 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  35.79 
 
 
413 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1987  hypothetical protein  31.88 
 
 
612 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.59198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  35.79 
 
 
756 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  33.33 
 
 
288 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  32.72 
 
 
1081 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.75 
 
 
3027 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.39 
 
 
1328 aa  99.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  32.56 
 
 
834 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-05  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  36.57 
 
 
822 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.77462e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  37.22 
 
 
1042 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  32.97 
 
 
413 aa  98.2  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  29.71 
 
 
914 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  34.12 
 
 
1168 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.42 
 
 
688 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.81 
 
 
1029 aa  96.3  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  34.62 
 
 
733 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  32.76 
 
 
554 aa  95.5  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  31.35 
 
 
1710 aa  94.7  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  38.97 
 
 
286 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  33.89 
 
 
431 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  35.23 
 
 
807 aa  94  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.72 
 
 
1234 aa  93.6  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  3.68528e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  32.07 
 
 
669 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  32.24 
 
 
620 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  35.67 
 
 
857 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  35.88 
 
 
618 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  31.32 
 
 
375 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.36 
 
 
631 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.24 
 
 
558 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  31.69 
 
 
620 aa  92  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  32.42 
 
 
939 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  31.15 
 
 
620 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40229e-08  hitchhiker  1.0382e-13 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  32.42 
 
 
615 aa  90.9  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.56588e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.31 
 
 
995 aa  90.5  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  29.65 
 
 
463 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  1.21353e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.61 
 
 
1495 aa  89.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  33.14 
 
 
1421 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.52 
 
 
6885 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  31.19 
 
 
754 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  35 
 
 
2207 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.81 
 
 
2313 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  30.99 
 
 
1223 aa  88.2  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 
640 aa  87.4  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  33.51 
 
 
880 aa  86.7  1e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.67 
 
 
447 aa  86.3  2e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  32 
 
 
1756 aa  86.3  2e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  29.91 
 
 
546 aa  85.9  2e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  31.1 
 
 
552 aa  85.9  2e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.45 
 
 
1054 aa  85.9  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  32.09 
 
 
530 aa  85.5  3e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>