More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1963 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1070    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  60.95 
 
 		 524 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  39.72 
 
 		 1194 aa  316  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1968  hypothetical protein  49.67 
 
 		 425 aa  274  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  32.23 
 
 		 506 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  57.75 
 
 		 457 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  59.22 
 
 		 548 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  55.75 
 
 		 625 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  49.74 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  53.22 
 
 		 758 aa  193  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  51.67 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1961  hypothetical protein  36.36 
 
 		 300 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  44.05 
 
 		 218 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1962  hypothetical protein  33.09 
 
 		 298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  35.62 
 
 		 935 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  41.04 
 
 		 926 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  38.29 
 
 		 693 aa  134  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  39.57 
 
 		 710 aa  133  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  39.67 
 
 		 1821 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  42.46 
 
 		 1208 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  36.57 
 
 		 1321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  38.29 
 
 		 1226 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  35.75 
 
 		 542 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  38.42 
 
 		 629 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  39.29 
 
 		 288 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  38.51 
 
 		 1154 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  36.36 
 
 		 920 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  40.45 
 
 		 506 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  37.28 
 
 		 531 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  39.13 
 
 		 223 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  38.41 
 
 		 932 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  37.57 
 
 		 573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  36.93 
 
 		 4630 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3496  hypothetical protein  33.91 
 
 		 557 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  39.08 
 
 		 1009 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  36.87 
 
 		 921 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  36.93 
 
 		 1174 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  38.8 
 
 		 767 aa  113  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  36.07 
 
 		 685 aa  113  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 1013 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  34.1 
 
 		 631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.31 
 
 		 1054 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  35.09 
 
 		 1081 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  37.14 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.71 
 
 		 1661 aa  107  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1260 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 		 1328 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  33.52 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  31.03 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  38.32 
 
 		 615 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.97 
 
 		 1016 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 		 1029 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  33.53 
 
 		 1168 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  34.48 
 
 		 660 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.05 
 
 		 558 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  34.25 
 
 		 834 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  35.52 
 
 		 733 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  35.23 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  36.05 
 
 		 2207 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  37.43 
 
 		 1847 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  34.5 
 
 		 620 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  34.08 
 
 		 413 aa  100  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  34.5 
 
 		 1042 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  33.89 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  32.46 
 
 		 693 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  33.52 
 
 		 1710 aa  97.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  33.15 
 
 		 548 aa  96.7  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 620 aa  96.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  33.7 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  31.49 
 
 		 756 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  32.93 
 
 		 620 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  33.15 
 
 		 1495 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.91 
 
 		 631 aa  94  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  36.49 
 
 		 857 aa  93.6  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  32.39 
 
 		 692 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.37 
 
 		 3027 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  34.1 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  33.93 
 
 		 618 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  34.64 
 
 		 575 aa  90.5  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  29.21 
 
 		 669 aa  90.1  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.1 
 
 		 572 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  32.32 
 
 		 1223 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  30.56 
 
 		 546 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  36.63 
 
 		 531 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.53 
 
 		 567 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.1 
 
 		 567 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  34.3 
 
 		 807 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  31.15 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  28.41 
 
 		 657 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.05 
 
 		 995 aa  88.6  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  31.21 
 
 		 375 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.62 
 
 		 2313 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  35.88 
 
 		 822 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.54 
 
 		 447 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1054  S-layer-like region  31.12 
 
 		 422 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  31.94 
 
 		 599 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  30.81 
 
 		 914 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  31.91 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>