More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1924 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  100 
 
 		 657 aa  1346    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  42.12 
 
 		 660 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  40.22 
 
 		 506 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.33 
 
 		 1821 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  35.15 
 
 		 758 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34.5 
 
 		 693 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  32.14 
 
 		 1154 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  30.39 
 
 		 710 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.23 
 
 		 1328 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.96 
 
 		 4630 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  36.21 
 
 		 625 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  32.68 
 
 		 1226 aa  104  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  34.07 
 
 		 1208 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  35.63 
 
 		 820 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  31.55 
 
 		 218 aa  100  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  32.8 
 
 		 685 aa  98.2  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  35.54 
 
 		 932 aa  97.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  32.95 
 
 		 526 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1194 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  30.52 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  34.94 
 
 		 457 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  35.63 
 
 		 548 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  31.52 
 
 		 767 aa  96.3  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  31.4 
 
 		 375 aa  93.6  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.83 
 
 		 926 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.69 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  30.56 
 
 		 920 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  29.28 
 
 		 552 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  28.84 
 
 		 748 aa  91.3  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  31.89 
 
 		 1710 aa  90.9  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  29.6 
 
 		 546 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  28.9 
 
 		 518 aa  89  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  30.69 
 
 		 935 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.35 
 
 		 1029 aa  87  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  30.27 
 
 		 1168 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  29.02 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  29.68 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  26.07 
 
 		 834 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  28.41 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  29.94 
 
 		 914 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  29.79 
 
 		 573 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 939 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  29.22 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  26.67 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  24.52 
 
 		 805 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2183  hypothetical protein  30.62 
 
 		 570 aa  81.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  29.77 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  29.61 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  29.31 
 
 		 921 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  27.84 
 
 		 693 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  28.03 
 
 		 575 aa  80.5  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  28.37 
 
 		 863 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  27.31 
 
 		 807 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  28.43 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 		 995 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  27.47 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.21 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  23.38 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 1321 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  27.53 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  29.73 
 
 		 1174 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  26.42 
 
 		 585 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 1009 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 857 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.77 
 
 		 447 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.02 
 
 		 618 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  28.08 
 
 		 822 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  27.59 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  27.51 
 
 		 223 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  28.43 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  29.61 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  26.86 
 
 		 1847 aa  75.5  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.84 
 
 		 1016 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.94 
 
 		 1234 aa  75.1  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  27.59 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  27.59 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  27.09 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  27.59 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.73 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.95 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  29.32 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.95 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.95 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 631 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  26.34 
 
 		 521 aa  73.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.44 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  27.17 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.59 
 
 		 688 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  32.81 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1962  putative S-layer protein  24.32 
 
 		 331 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000041962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.5 
 
 		 1661 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  28.09 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  28.09 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2344  S-layer domain-containing protein  27.62 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1260 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.57 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  24.58 
 
 		 1081 aa  70.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  26.96 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>