More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1922 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1922  GTPase  100 
 
 		 375 aa  755    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  50.97 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  49.04 
 
 		 413 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.81 
 
 		 422 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.73 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  47.04 
 
 		 435 aa  301  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  43.45 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  43.18 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  43.45 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  43.45 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  43.45 
 
 		 401 aa  299  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  43.18 
 
 		 419 aa  299  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  53.4 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  42.9 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  42.9 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  53.4 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  43.18 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  53.4 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  43.18 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  53.4 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.5 
 
 		 441 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  53.4 
 
 		 425 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  53.4 
 
 		 425 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  49.45 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  53.4 
 
 		 420 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  53.09 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  52.78 
 
 		 425 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  52.78 
 
 		 425 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.15 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  53.56 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  47.4 
 
 		 582 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  51.18 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  46.28 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  46.01 
 
 		 396 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  46.01 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  46.01 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  46.01 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  46.09 
 
 		 392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  46.01 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  48.96 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45.58 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  46.94 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  45.81 
 
 		 387 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  45.81 
 
 		 387 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  45.81 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  45.81 
 
 		 387 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  45.81 
 
 		 387 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  45.81 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  45.81 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  45.59 
 
 		 412 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.37 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.37 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.37 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  48.19 
 
 		 596 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  45.45 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  47.63 
 
 		 509 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  41.39 
 
 		 419 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  44.7 
 
 		 412 aa  276  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  45.58 
 
 		 482 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.48 
 
 		 433 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  44.96 
 
 		 414 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.75 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  44.85 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  47.97 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  45.64 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  45.64 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  44.66 
 
 		 433 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  44.57 
 
 		 434 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  44.66 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  44.63 
 
 		 436 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  44.86 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  50.29 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  43.72 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.38 
 
 		 417 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  46.2 
 
 		 512 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  44.89 
 
 		 501 aa  268  8e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  41.86 
 
 		 437 aa  268  8.999999999999999e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  44.38 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.88 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.86 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.86 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.35 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  47.73 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  44.12 
 
 		 479 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  44.34 
 
 		 406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  44.95 
 
 		 431 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  46.08 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.82 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  43.63 
 
 		 503 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  49.42 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  45.67 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  44.24 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  43.16 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  40.86 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.14 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  43.8 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.36 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  46.89 
 
 		 420 aa  262  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  43.17 
 
 		 435 aa  262  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>