More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1890 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  100 
 
 		 262 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  54.25 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  54.25 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  49.4 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  54.66 
 
 		 249 aa  271  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 254 aa  261  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  48.99 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  54.25 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  52.5 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  45.82 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  46.4 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  45.76 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  48.15 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  47.48 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  44.13 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  42.97 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  48.34 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  46.15 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  48.57 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  44.69 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 255 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  44.25 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  44.25 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  40.08 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.81 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  43.4 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1687  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  43.24 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  38.68 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.62 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  41.59 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 250 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  39.25 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.84 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  37.3 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  38.99 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  39.5 
 
 		 273 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  39.34 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  39.34 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  39.91 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  39.91 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  40.45 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  39.57 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  41.9 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  39.73 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  40.55 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  36.91 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  34.02 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  42.18 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  40.45 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  38.07 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  40 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  36.91 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  37.29 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  37.93 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.34 
 
 		 418 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  36.82 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  37.93 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  35.42 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  42.92 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0118  ABC transporter related  39.53 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.4303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  38.89 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  39.18 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  37.3 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.44 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>