More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1888 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
332 aa  685    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.66 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.33 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.93 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.44 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.22 
 
 
263 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.94 
 
 
206 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.67 
 
 
283 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.64 
 
 
236 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.15 
 
 
223 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.78 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.07 
 
 
289 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.79 
 
 
192 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.34 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.2 
 
 
115 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.91 
 
 
181 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.47 
 
 
112 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.96 
 
 
294 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.59 
 
 
205 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.73 
 
 
165 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.54 
 
 
411 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.61 
 
 
186 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.79 
 
 
165 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  41.61 
 
 
186 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  41.61 
 
 
186 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.13 
 
 
167 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.27 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  41.61 
 
 
186 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.67 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2845  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.74 
 
 
169 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0304  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.54 
 
 
168 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.92 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.18 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.17 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.31 
 
 
389 aa  82.4  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.33 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.93 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.3 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  36.67 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5143  hypothetical protein  32.61 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4899  hypothetical protein  32.61 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5274  hypothetical protein  32.61 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4743  hypothetical protein  31.88 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4762  hypothetical protein  32.61 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5178  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.7 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5187  hypothetical protein  31.88 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5172  hypothetical protein  31.88 
 
 
153 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  32.61 
 
 
153 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3616  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.77 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0806  hypothetical protein  38.18 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2943  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.3 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.06 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0411  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0481  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.16 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469394  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5015  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.5 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.8 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2889  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.21 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.09 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4333  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.82 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1457  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein family protein  35.77 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000050747  normal  0.073975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.19 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.59034  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0678  hypothetical protein  30.82 
 
 
179 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.92298  normal  0.301667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1637  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.77 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000221895  hitchhiker  0.00347843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1796  hypothetical protein  36.36 
 
 
526 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00047579  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18821  hypothetical protein  31.29 
 
 
180 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.56 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.71 
 
 
219 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1862  hypothetical protein  34.75 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.263465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
204 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2218  hypothetical protein  32.79 
 
 
180 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2629  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.8 
 
 
463 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279699  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.79 
 
 
180 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1402  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.84 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742289  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0927  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
432 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000328138  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07261  hypothetical protein  32.5 
 
 
243 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5278  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.2 
 
 
132 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299006  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.93 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2026  hypothetical protein  33.09 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198404  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1682  hypothetical protein  32.54 
 
 
163 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.412549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.62 
 
 
490 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
231 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0965  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.07 
 
 
254 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.398269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4081  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.11 
 
 
409 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0060  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.09 
 
 
171 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>