More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1878 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  41.67 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  41.99 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  44.54 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  43.91 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  42.79 
 
 		 237 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  43.67 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  41.99 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  37.39 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  39.92 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  40.87 
 
 		 602 aa  164  9e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  44.93 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  44.93 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  44.93 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  40.45 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  35.34 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  38.2 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  44.13 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  35.83 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  37.45 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  41.31 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  36.91 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  40.97 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  39.15 
 
 		 298 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  39.41 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  37.97 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  40.48 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  41.23 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  37.21 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  42.36 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  43.97 
 
 		 238 aa  148  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  38.6 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  42.45 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37.91 
 
 		 241 aa  147  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  40.53 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.79 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  38.36 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  42.93 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  35.53 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  39.53 
 
 		 273 aa  144  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.2 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  34.6 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  35.86 
 
 		 253 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  41.84 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  38.99 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  38.53 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  36.84 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.79 
 
 		 238 aa  137  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  34.51 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  34.51 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  33.06 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  41.71 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  41.15 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  35.22 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  34.75 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  43.02 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  36.92 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  36.89 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  40.87 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  41.15 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  33.47 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  34.62 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  39.02 
 
 		 272 aa  121  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  38.65 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  33.49 
 
 		 266 aa  121  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  34.1 
 
 		 254 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.02 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  38.1 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  38.1 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  38.1 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  37.44 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  36.87 
 
 		 229 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  41.42 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  36.74 
 
 		 409 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  36.24 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  36.24 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  33.47 
 
 		 255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  35.08 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  34.51 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1099  peptidase C26  36.59 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  35.02 
 
 		 258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  34.16 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  31.67 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  41.07 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  35.35 
 
 		 407 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  33.05 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  37.85 
 
 		 299 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  32.62 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  41.04 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  32.5 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  33.33 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  36.95 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  35.74 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  32.5 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  35.75 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  34.47 
 
 		 279 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  35.32 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  34.47 
 
 		 279 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>