More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1869 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  42.31 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  45.91 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  43.15 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  39.47 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  41.06 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  38.67 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  41.45 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  41.78 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  41.38 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.76 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  40.4 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.14 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  43.24 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.38 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.16 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  38.19 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  40.14 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  39.87 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.16 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.49 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.16 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  42.57 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  37.16 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  37.16 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  39.74 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  39.47 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  36.49 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.49 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  38.36 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  38.36 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  40.4 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  38.1 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  38.1 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.01 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  36 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  36 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  39.04 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  43.88 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  40.79 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  38.06 
 
 		 149 aa  97.8  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  46.02 
 
 		 143 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  43.55 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  34.46 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  36.77 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  39.16 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  39.31 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.85 
 
 		 176 aa  97.1  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  41.79 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  40.41 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  39.29 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  39.22 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.36 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  40.15 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  37.91 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  45.38 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  37.09 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  40.32 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  40.32 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.19 
 
 		 150 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 		 184 aa  94  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  38.57 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  37.25 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  37.25 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  45.05 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.76 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  41.74 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.16 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  42.11 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  38.73 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.42 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  37.25 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  40.13 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  40.44 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  36.96 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  39.39 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  40.5 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  37.75 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  34.42 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  38.03 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  38.03 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.28 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  33.78 
 
 		 174 aa  90.9  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  36.42 
 
 		 503 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  35.29 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>