More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1865 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1865  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
253 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.827419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.73 
 
 
258 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2837  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.14 
 
 
256 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.14 
 
 
256 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.68 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.63 
 
 
249 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.532012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0062  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.4 
 
 
295 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0951  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.84 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.81 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.5 
 
 
263 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000370596  hitchhiker  0.000000000404856 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.44 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1235  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.62 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1890  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.95 
 
 
252 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00906876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.82 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.43 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.95 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.87 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.2 
 
 
273 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.93 
 
 
250 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.32 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0417  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.21 
 
 
276 aa  109  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.38 
 
 
267 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.27 
 
 
293 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.84 
 
 
273 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.94 
 
 
260 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.54 
 
 
281 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0181566  normal  0.0698787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.08 
 
 
256 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.3 
 
 
256 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.68 
 
 
279 aa  105  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.88 
 
 
271 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.2 
 
 
283 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.3 
 
 
261 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.82 
 
 
261 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.15 
 
 
279 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.22 
 
 
357 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.15 
 
 
279 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.54 
 
 
262 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.95 
 
 
268 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.33 
 
 
268 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.13 
 
 
266 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.76 
 
 
257 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.95 
 
 
268 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.95 
 
 
268 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.16 
 
 
257 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.42 
 
 
271 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.67 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.46 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
270 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.58 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.69 
 
 
285 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3510  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.25 
 
 
265 aa  99  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.905017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.2 
 
 
357 aa  98.6  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.8 
 
 
271 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0393  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.39 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.48 
 
 
276 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.23 
 
 
296 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.84 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.8 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.23 
 
 
296 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.48 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.52 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1732  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.29 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.52 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.25 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.81 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.49 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.83 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.52 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.83 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.83 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.52 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.21 
 
 
292 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.18 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.28 
 
 
284 aa  95.9  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.43 
 
 
296 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.75 
 
 
267 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
296 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.36 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.23 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.88 
 
 
289 aa  95.1  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.55 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.08 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.78 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
360 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.15 
 
 
296 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.64 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0795  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.58 
 
 
285 aa  93.2  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.63 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.42 
 
 
293 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.27 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.8 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.83 
 
 
268 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>