More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1770 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  100 
 
 
387 aa  780    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  44.66 
 
 
389 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  40.76 
 
 
389 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.64 
 
 
418 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  37.94 
 
 
383 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  40.22 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.26 
 
 
438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  36.31 
 
 
380 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  33.42 
 
 
419 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.79 
 
 
440 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.16 
 
 
440 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
418 aa  225  9e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
418 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
418 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.82 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.88 
 
 
428 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.86 
 
 
434 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.6 
 
 
438 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
418 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  37.91 
 
 
346 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.6 
 
 
429 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  32.05 
 
 
409 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.33 
 
 
420 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.33 
 
 
420 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.31 
 
 
420 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.69 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.69 
 
 
420 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.69 
 
 
420 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.69 
 
 
420 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.69 
 
 
420 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.69 
 
 
420 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.38 
 
 
420 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  29.49 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.61 
 
 
392 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
431 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  37 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
410 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
409 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
421 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.68 
 
 
413 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
410 aa  176  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.73 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.21 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
419 aa  173  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  34.49 
 
 
368 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
426 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 
417 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 
429 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
421 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
377 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 
470 aa  167  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
408 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.35 
 
 
392 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 
448 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.61 
 
 
404 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 
538 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 
457 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.88 
 
 
401 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
554 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
410 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 
421 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 
430 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
421 aa  156  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
439 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
420 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
423 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  32.94 
 
 
404 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
423 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
429 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.45 
 
 
395 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
429 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
419 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
423 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
423 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
423 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 
436 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
434 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  33.53 
 
 
423 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
423 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
423 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  30.3 
 
 
466 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
415 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.35 
 
 
517 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
432 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
423 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
428 aa  149  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
454 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
420 aa  149  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
429 aa  149  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>