More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1719 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  100 
 
 
324 aa  646    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  57.81 
 
 
334 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  57.14 
 
 
329 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  57.19 
 
 
334 aa  388  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.81 
 
 
333 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.39 
 
 
325 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.21 
 
 
333 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.8 
 
 
341 aa  347  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.11 
 
 
325 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.37 
 
 
334 aa  339  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.38 
 
 
327 aa  328  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.11 
 
 
356 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.59 
 
 
379 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.63 
 
 
327 aa  322  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.68 
 
 
338 aa  319  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  51.45 
 
 
318 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.6 
 
 
334 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  51.31 
 
 
324 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.1 
 
 
334 aa  315  7e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  49.36 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  49.67 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  46.98 
 
 
317 aa  309  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  47.45 
 
 
356 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.8 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  49.06 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.5 
 
 
320 aa  306  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.09 
 
 
345 aa  305  6e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.88 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.21 
 
 
313 aa  300  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  45.4 
 
 
317 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  49.53 
 
 
335 aa  298  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  49.21 
 
 
335 aa  298  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  48.09 
 
 
335 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  48.26 
 
 
343 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  47.66 
 
 
338 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  48.36 
 
 
349 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.58 
 
 
341 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.58 
 
 
341 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  45.19 
 
 
335 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  46.06 
 
 
335 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  44.83 
 
 
336 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  47.21 
 
 
342 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  48.01 
 
 
339 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 
331 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.01 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.71 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  46.84 
 
 
333 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.06 
 
 
334 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.92 
 
 
336 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.13 
 
 
329 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  45.45 
 
 
332 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  47.67 
 
 
333 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.2 
 
 
324 aa  279  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  47.25 
 
 
336 aa  279  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.25 
 
 
336 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  47.21 
 
 
362 aa  278  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 
336 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  46.79 
 
 
333 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.52 
 
 
432 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  45.08 
 
 
346 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.57 
 
 
336 aa  278  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.43 
 
 
336 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  47.08 
 
 
337 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  43.77 
 
 
332 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  45.14 
 
 
334 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  44.14 
 
 
334 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  45.25 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  46.86 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  45.89 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  42.72 
 
 
328 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  43.52 
 
 
332 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  46.18 
 
 
338 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  47.54 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.25 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  49.67 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  47.81 
 
 
330 aa  272  7e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  45.57 
 
 
345 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  46.65 
 
 
327 aa  271  8.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  44.51 
 
 
337 aa  271  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.34 
 
 
332 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  45.51 
 
 
338 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  45.95 
 
 
337 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  45.51 
 
 
338 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 
350 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.53 
 
 
341 aa  269  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  43.34 
 
 
332 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.58 
 
 
350 aa  269  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.9 
 
 
360 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  47.19 
 
 
345 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  44.62 
 
 
340 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  43.56 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.69 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  43.22 
 
 
330 aa  265  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  45.68 
 
 
335 aa  265  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.6 
 
 
329 aa  265  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.54 
 
 
327 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.08 
 
 
310 aa  264  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>