More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1694 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  59.92 
 
 		 260 aa  331  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  50.19 
 
 		 264 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  49.81 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  52.14 
 
 		 256 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  51.36 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  51.36 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  51.76 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  46.48 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  42.91 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  46.9 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  47.43 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  45.45 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  43.97 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  43.14 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  47.89 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  47.74 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  42.64 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  43.41 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  43.02 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  44.18 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  44.09 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  45 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  41.31 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  40.77 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  42.59 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.59 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  44.36 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  41.39 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  45.99 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  41.6 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  39.43 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  43.46 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  45.57 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  38.02 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1513  ABC transporter related  46.58 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  41.33 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  39.75 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  39.27 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.45 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  42.86 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  39.75 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  40.91 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.75 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.83 
 
 		 409 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  42.37 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.65 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  36.73 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.93 
 
 		 414 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.22 
 
 		 405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.66 
 
 		 418 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  33.47 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.36 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.7 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  37.14 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.29 
 
 		 444 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  35.95 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  38.2 
 
 		 424 aa  169  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 490 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  40.71 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.73 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.91 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  35.66 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  38.59 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 257 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 418 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.08 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  36.32 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  37.6 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  36.67 
 
 		 421 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>