More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1690 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  100 
 
 		 366 aa  754    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  65.03 
 
 		 378 aa  485  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  55.4 
 
 		 375 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  40.65 
 
 		 376 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  39.4 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  42.18 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  39.07 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  41.52 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  37.11 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  38.63 
 
 		 348 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  37.38 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  39.2 
 
 		 363 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  37.53 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  39.08 
 
 		 370 aa  245  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  34.08 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  36.76 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  36.2 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.53 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.88 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  38.18 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  33.99 
 
 		 350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  35.06 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  35.67 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  34.06 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  35.98 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  32.86 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  32.71 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  35.41 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  31.81 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  34.78 
 
 		 343 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  34.76 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  35.28 
 
 		 348 aa  199  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  32.93 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  32.02 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  30.4 
 
 		 382 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  34.59 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  34.59 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.25 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  31.94 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  35.69 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  32.5 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  32.7 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  28.77 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  30.05 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  28.44 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  30.79 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  31.34 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.39 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  28.57 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  30.16 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  27.38 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.83 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.49 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.56 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.81 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  24.87 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.54 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.32 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  28.57 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  31.64 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.98 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.45 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  32.64 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.62 
 
 		 349 aa  93.2  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  25.65 
 
 		 403 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.71 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.87 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  28.02 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>