217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1672 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  558  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  36.3 
 
 
279 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  35.61 
 
 
270 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  32.84 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  33.2 
 
 
275 aa  115  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  33.09 
 
 
273 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  28.81 
 
 
264 aa  106  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  29.72 
 
 
270 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
280 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  31.94 
 
 
263 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  28.97 
 
 
275 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  28.87 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  32.54 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  30.41 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  30.8 
 
 
302 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.68 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  31.03 
 
 
265 aa  92  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  28.27 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.94 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  27.08 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  26.67 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.09 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  29.43 
 
 
279 aa  87  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  28.41 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  31.27 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  28.45 
 
 
279 aa  85.5  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  26.94 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  31.86 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  28.03 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 
323 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
288 aa  79  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  32.03 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  27.8 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  29.84 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  29.84 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.59 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
298 aa  72  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.53 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  29.77 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  23.28 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  28.22 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  25.57 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  26.29 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  30.98 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  24.19 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  25.32 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  23.33 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  30.1 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  26.17 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  29.11 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.09 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  26.09 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  27.75 
 
 
237 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  26.29 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  32.81 
 
 
194 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  40.45 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  28.12 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  28.93 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  26.83 
 
 
232 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  31.91 
 
 
239 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  32.98 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.09 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  26.99 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  31.53 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  26.29 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.32 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  46.3 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
274 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
283 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  35.63 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  23.95 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  27.54 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  25.74 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  38.67 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
240 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.52 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  42.59 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  39.22 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  24.48 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>