238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1625 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  73.77 
 
 
251 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  49.8 
 
 
242 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  43.78 
 
 
245 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  40.64 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  42.47 
 
 
181 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  40.44 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  40.22 
 
 
184 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  39.01 
 
 
187 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  42.93 
 
 
193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  37.77 
 
 
192 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  35.71 
 
 
187 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  39.01 
 
 
191 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  40.12 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  34.57 
 
 
202 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  36.32 
 
 
190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  36.7 
 
 
190 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  39.27 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  36.9 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  38.71 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  35.98 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  39.04 
 
 
200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  28.9 
 
 
218 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  36.51 
 
 
193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  38.46 
 
 
192 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  36.65 
 
 
191 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  37.36 
 
 
190 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  34.05 
 
 
191 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  38.06 
 
 
197 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  40.14 
 
 
198 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  38.62 
 
 
183 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  34.57 
 
 
200 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  39.35 
 
 
207 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  34.92 
 
 
193 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  33.69 
 
 
193 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  34.05 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  35.95 
 
 
195 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  30.81 
 
 
257 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  34.57 
 
 
185 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  34.88 
 
 
180 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  35.56 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  36.49 
 
 
201 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1085  hypothetical protein  37.72 
 
 
119 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  28.71 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 
184 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  33.11 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  34.01 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  35.17 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  31.02 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.19 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  31.58 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30.27 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  33.56 
 
 
197 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  32.86 
 
 
153 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  30.07 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  29.66 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  32.82 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  29.31 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  32.29 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.23 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  30.77 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  30.52 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  32.85 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  32.04 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  34.53 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  30.91 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  31.05 
 
 
186 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  39.62 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  33.8 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  32.47 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  31.25 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  27.32 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  25.54 
 
 
188 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  25.53 
 
 
188 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  31.76 
 
 
218 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
194 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  28.42 
 
 
191 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  25.53 
 
 
188 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  26.29 
 
 
193 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  27.89 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.1 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
187 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  31.29 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  30.64 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  24.65 
 
 
205 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  34.43 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  26.22 
 
 
184 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  27.13 
 
 
203 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  27.96 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 
188 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
188 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>