More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1598 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  838    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  28.86 
 
 
228 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  29.55 
 
 
221 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  42.45 
 
 
160 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  29.39 
 
 
238 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  24.66 
 
 
218 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
225 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  36.92 
 
 
563 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.21 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.19 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  34.53 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 
215 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  28.12 
 
 
214 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  23.53 
 
 
222 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.5 
 
 
225 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.87 
 
 
226 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  25.24 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  35.65 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.21 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
247 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.26 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.43 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  29.37 
 
 
222 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.52 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.37 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.67 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  33.9 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.75 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.71 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  35.96 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  24.64 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.23 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.17 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.62 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.09 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.91 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  26.97 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.81 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.95 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.51 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  35.4 
 
 
194 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  31.53 
 
 
738 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 
1075 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
577 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
236 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  35.4 
 
 
149 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  34.95 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.11 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.48 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.89 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  25 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.6 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  34.23 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  30.91 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.62 
 
 
637 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  35.87 
 
 
237 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  34.21 
 
 
217 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3293  hypothetical protein  24.4 
 
 
276 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451573  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.05 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 
507 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 
570 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  26.67 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 
155 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
226 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1715  uncharacterized protein-like protein  27.49 
 
 
220 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0306638  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.45 
 
 
237 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2085  cyclic nucleotide binding protein  30.48 
 
 
238 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.52 
 
 
243 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0244  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
228 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  25.91 
 
 
218 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  25.91 
 
 
218 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.81 
 
 
223 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.35 
 
 
226 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
227 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
249 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 
167 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
1056 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 
224 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>