More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1564 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  46.25 
 
 
159 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  43.67 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  45.71 
 
 
142 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  41.94 
 
 
156 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  49.62 
 
 
157 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  42.31 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.65 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  41.67 
 
 
153 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  42.95 
 
 
156 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  43.23 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  40.24 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  44.09 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  40.24 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 
152 aa  110  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  40.49 
 
 
162 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42 
 
 
301 aa  110  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.39 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  42.76 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  42.11 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  42.11 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  42.11 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  42.11 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  42.11 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  42.11 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  40.25 
 
 
161 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  42.76 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  43.06 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.45 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  42.65 
 
 
159 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  39.35 
 
 
159 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  41.86 
 
 
174 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  41.21 
 
 
165 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  45.9 
 
 
155 aa  103  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  43.97 
 
 
154 aa  101  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  44.8 
 
 
155 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  44.8 
 
 
155 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  39.63 
 
 
160 aa  100  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.04 
 
 
153 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  37.16 
 
 
446 aa  98.6  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  40.5 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  39.13 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.84 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  36.54 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  38.03 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  37.23 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  36.91 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  43.09 
 
 
201 aa  94.4  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  37.82 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  40.15 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  37.21 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  43.2 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  42.4 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  35.46 
 
 
180 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  41.67 
 
 
174 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  37.23 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  40.77 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  40.87 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  36.65 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.07 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  39.86 
 
 
177 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  39.86 
 
 
177 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  35.95 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  39.86 
 
 
177 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  35.26 
 
 
172 aa  90.5  9e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  35.82 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  35.25 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  38.73 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  42.11 
 
 
150 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  42.4 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  35.97 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  41.18 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 
187 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  36.43 
 
 
178 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  33.78 
 
 
184 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  39.17 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  44.95 
 
 
183 aa  87.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  40.91 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  38.17 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  38.17 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  37.21 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  36.64 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  41.13 
 
 
186 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  35.82 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  40.17 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.96 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  38.98 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  37.98 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  39.82 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  35.62 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  39.47 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.17 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  39.1 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  41.9 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  38.38 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  39.2 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>