53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1532 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1532  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  242  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000937185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1447  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.29 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.180585 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1187  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.39 
 
 
119 aa  84  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0461  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.5 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0659  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.39 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2080  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.51 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1834  hypothetical protein  36.28 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1955  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.7 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1235  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.5 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000993982  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0749  hypothetical protein  36.7 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1529  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.84 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.74 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.033243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18390  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.84 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2421  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.94 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1686  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.91 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  33.33 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1126  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.46 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000186803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2428  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.04 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1433  hypothetical protein  40.54 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0581  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.94 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1087  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.74 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000745199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1584  hypothetical protein  33.94 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1412  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.53 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000101949  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0621  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.21 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0445  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0339  hypothetical protein  30.28 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0099147  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.17 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0303334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1867  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.09 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2223  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.33 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0700085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0011  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.46 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2024  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.41 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.798797  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3198  hypothetical protein  33.02 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1056  hypothetical protein  33.03 
 
 
248 aa  55.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  35.64 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1250  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.17 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.231399  normal  0.681638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2164  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.35 
 
 
110 aa  53.9  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0560  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.21 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.124562  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.78 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0047  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.7 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3008  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.16 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.65 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1982  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.4 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.59 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0193  hypothetical protein  30.63 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1481  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.97 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0395  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.69 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.87 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1231  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.68 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000822502  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1123  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.18 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.21 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1553  hypothetical protein  27.78 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0367  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  20.88 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.37 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>