77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1514 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1349  signal-transduction protein  59.81 
 
 
213 aa  245  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000217983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3046  putative signal transduction protein with CBS domains  54.55 
 
 
212 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174449  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2471  signal-transduction protein  50.48 
 
 
211 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  50.94 
 
 
211 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4253  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.48 
 
 
215 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1209  CBS domain containing protein  50.72 
 
 
211 aa  224  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0176414  normal  0.169489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3023  CBS domain-containing protein  48.37 
 
 
211 aa  222  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  48.34 
 
 
210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  48.34 
 
 
210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  48.34 
 
 
210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  48.34 
 
 
210 aa  221  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  47.87 
 
 
210 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  47.87 
 
 
210 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  48.34 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  47.87 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  47.87 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  47.44 
 
 
211 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1732  CBS domain containing protein  50.71 
 
 
209 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  47.14 
 
 
209 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2269  CBS domain-containing protein  53.3 
 
 
210 aa  214  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0486  signal-transduction protein  50.71 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1984  CBS domain-containing protein  52.61 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  47.83 
 
 
207 aa  211  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  48.83 
 
 
210 aa  207  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1032  CBS domain containing protein  46.97 
 
 
197 aa  207  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  48.34 
 
 
238 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1622  CBS domain-containing protein  46.37 
 
 
179 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1656  CBS domain-containing protein  46.37 
 
 
179 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2384  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.71 
 
 
212 aa  157  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1672  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
170 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 
209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  30.41 
 
 
488 aa  49.3  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  34.69 
 
 
143 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  28.18 
 
 
127 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  33.59 
 
 
513 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  33.59 
 
 
513 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  29.36 
 
 
182 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2254  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.38 
 
 
169 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454086 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  30.66 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  31.62 
 
 
513 aa  45.4  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  26.12 
 
 
127 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30.43 
 
 
502 aa  45.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  27.27 
 
 
128 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  27.16 
 
 
130 aa  45.1  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.86 
 
 
903 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.74 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0523  KpsF/GutQ family protein  27.07 
 
 
323 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  26.09 
 
 
327 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
131 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  34.12 
 
 
380 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  29.55 
 
 
332 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  26.96 
 
 
339 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  26.09 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  28.33 
 
 
141 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0629  KpsF/GutQ family protein  30 
 
 
328 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 
136 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.25 
 
 
490 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  24.56 
 
 
327 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 
615 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 
139 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  30.85 
 
 
331 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 
139 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  31.96 
 
 
503 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.88 
 
 
903 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  24.06 
 
 
131 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  28.3 
 
 
139 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 
638 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 
139 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  28.26 
 
 
330 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 
139 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  30.51 
 
 
329 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  26.89 
 
 
615 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  30.34 
 
 
398 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>