More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1468 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1139    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  38.62 
 
 
576 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  34 
 
 
563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  34.02 
 
 
561 aa  314  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  34.44 
 
 
585 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.74 
 
 
578 aa  306  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  34.63 
 
 
582 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.94 
 
 
571 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  35.45 
 
 
560 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  33.4 
 
 
588 aa  292  9e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  31.34 
 
 
561 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  33.78 
 
 
610 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.95 
 
 
584 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  34.83 
 
 
562 aa  287  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  32.41 
 
 
559 aa  286  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  34.61 
 
 
562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  34.61 
 
 
562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 
556 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  32.44 
 
 
570 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  33.33 
 
 
558 aa  280  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  32.71 
 
 
562 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  33.12 
 
 
514 aa  272  9e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.57 
 
 
558 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  32.79 
 
 
566 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  34.36 
 
 
582 aa  266  8.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.01 
 
 
557 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.05 
 
 
559 aa  265  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  31.42 
 
 
613 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  30.28 
 
 
560 aa  263  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  30.39 
 
 
557 aa  262  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  34.44 
 
 
574 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  30.66 
 
 
558 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  32 
 
 
555 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.27 
 
 
554 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0318  hypothetical protein  33.88 
 
 
592 aa  259  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0340511  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  35.15 
 
 
670 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  30.44 
 
 
545 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.29 
 
 
558 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.37 
 
 
573 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.52 
 
 
558 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  37.99 
 
 
629 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2693  protein kinase  38.03 
 
 
619 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3101  ABC-1 domain protein  30.87 
 
 
564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  36.32 
 
 
619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  34.51 
 
 
544 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.35 
 
 
561 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  32.86 
 
 
569 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  36.14 
 
 
665 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  36.14 
 
 
665 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  32.59 
 
 
660 aa  253  7e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  35.52 
 
 
659 aa  253  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3296  hypothetical protein  35.98 
 
 
684 aa  253  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  36.5 
 
 
618 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  31.87 
 
 
555 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  28.65 
 
 
559 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  31.43 
 
 
555 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 
564 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.56 
 
 
559 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  34.75 
 
 
618 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  33.03 
 
 
689 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  29.75 
 
 
555 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  33.02 
 
 
567 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1003  hypothetical protein  30.07 
 
 
580 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  29.57 
 
 
541 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  32.46 
 
 
550 aa  247  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 
583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  34.62 
 
 
618 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  32.37 
 
 
578 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  31.26 
 
 
559 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  29.26 
 
 
551 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  35.81 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.98 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2319  protein kinase  36.34 
 
 
620 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.919005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.4 
 
 
561 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  34.38 
 
 
618 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  35.54 
 
 
619 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.61 
 
 
558 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.29 
 
 
557 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  34.44 
 
 
616 aa  243  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.42 
 
 
555 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  31.03 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.26 
 
 
561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  31.88 
 
 
553 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
526 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  34.28 
 
 
666 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  32.14 
 
 
572 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  33.18 
 
 
572 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  32.37 
 
 
583 aa  236  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  30.86 
 
 
561 aa  236  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  33.98 
 
 
640 aa  232  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  32.87 
 
 
556 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  30.69 
 
 
559 aa  231  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.99 
 
 
568 aa  229  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  28.74 
 
 
560 aa  229  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  33.87 
 
 
557 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  35.12 
 
 
560 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  30.08 
 
 
565 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  28.82 
 
 
552 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  34.01 
 
 
517 aa  226  7e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3797  ABC-1 domain protein  30.12 
 
 
516 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>