More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1435 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  57.66 
 
 
253 aa  301  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  57.03 
 
 
250 aa  298  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  55.24 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  53.91 
 
 
243 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  53.04 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  56.85 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  54.17 
 
 
242 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  51.39 
 
 
249 aa  271  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  54.07 
 
 
246 aa  271  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  54.73 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  52.78 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.25 
 
 
247 aa  268  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  52.99 
 
 
247 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  56.35 
 
 
252 aa  263  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  52.26 
 
 
247 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  49 
 
 
246 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  52.26 
 
 
247 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  51 
 
 
250 aa  259  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  54.39 
 
 
248 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  49.4 
 
 
248 aa  258  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  51.01 
 
 
246 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  51.04 
 
 
246 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  50.41 
 
 
247 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  50.41 
 
 
247 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  50.2 
 
 
247 aa  255  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  51.39 
 
 
249 aa  254  9e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  50.21 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50.41 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  50.79 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  49.6 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  50.4 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50.2 
 
 
245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  50.4 
 
 
247 aa  250  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  50.4 
 
 
250 aa  248  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  50.6 
 
 
248 aa  248  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  248  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  50.59 
 
 
252 aa  246  4e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  48.39 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  48.81 
 
 
248 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  48.41 
 
 
250 aa  245  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  244  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.02 
 
 
248 aa  244  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  48.61 
 
 
250 aa  244  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  48.61 
 
 
250 aa  244  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  48.81 
 
 
248 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  46.61 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  47.62 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.57 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  48.81 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  49.21 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  47.62 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.57 
 
 
253 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.41 
 
 
248 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  49.6 
 
 
250 aa  242  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  47.22 
 
 
248 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  48.81 
 
 
249 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  47.98 
 
 
250 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  49.8 
 
 
255 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.41 
 
 
248 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  47.62 
 
 
248 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  46.83 
 
 
248 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  49.79 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  46.77 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  46.22 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  49 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  48.02 
 
 
248 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  48.21 
 
 
249 aa  238  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  48.13 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.98 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  49.8 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  48.02 
 
 
248 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  48.02 
 
 
248 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  48.02 
 
 
248 aa  238  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.81 
 
 
247 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  48.41 
 
 
249 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  48.15 
 
 
248 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  49.2 
 
 
250 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  45.78 
 
 
249 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  47.81 
 
 
249 aa  235  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  48.02 
 
 
247 aa  234  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  46.15 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  48.19 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  48.19 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  45.53 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  50.62 
 
 
252 aa  232  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  46.03 
 
 
252 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  47.22 
 
 
248 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  48.41 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  48.55 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  48.02 
 
 
247 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  48.02 
 
 
247 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  46.43 
 
 
251 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  48.79 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  48.02 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>