More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1432 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  100 
 
 
199 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.85 
 
 
203 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  44 
 
 
197 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.22 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.09 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.82 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.86 
 
 
193 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.56 
 
 
201 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.56 
 
 
201 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.42 
 
 
204 aa  124  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  43.8 
 
 
206 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.36 
 
 
203 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.96 
 
 
193 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.04 
 
 
205 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.04 
 
 
205 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.04 
 
 
205 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.04 
 
 
205 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.27 
 
 
202 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.27 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.61 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.18 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
193 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.84 
 
 
197 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
200 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.13 
 
 
192 aa  117  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  35.53 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.7 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.88 
 
 
201 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
205 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
206 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.43 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
201 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.08 
 
 
205 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.61 
 
 
209 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.98 
 
 
202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.1 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.92 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.64 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.82 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.82 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.82 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.82 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  32.99 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.52 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.57 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 
199 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
198 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
201 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.83 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.93 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.36 
 
 
197 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  33.33 
 
 
191 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 
199 aa  111  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.86 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0973  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.77 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.46 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.47 
 
 
194 aa  111  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
194 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.71 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  39.29 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.97 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.91 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  37.5 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.29 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.63 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.18 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
190 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.51 
 
 
205 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>