165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1419 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1362  peptidase M50  52.6 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  45.45 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  52.36 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  46.31 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  52.2 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  45.73 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  44.04 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000643376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  41.36 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  45.27 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  49.17 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  51.37 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  45 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  43.48 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434184  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  42.23 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  46.93 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  43.69 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  45.99 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  46.15 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  46.15 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  41.4 
 
 		 224 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  42.86 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  43.56 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  40.86 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  40.86 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  40.31 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  41 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  40.31 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  40.86 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  42.86 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  40 
 
 		 247 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  42.71 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  39.2 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  40.32 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  40.32 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  38.73 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  40.32 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  38.6 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  46.07 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  39.91 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  40.72 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  43.78 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  39.9 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  41.79 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  41.8 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  41.29 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  39.29 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  38.83 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  42.7 
 
 		 228 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  44.02 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  41.62 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0819  peptidase M50  39.79 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  39.8 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  43.4 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  42.86 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2981  peptidase M50  37.7 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  41.54 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  38.14 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  39.15 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  39.15 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  39.15 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  39.15 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  39.15 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  39.5 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  40.51 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  40.51 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  40.51 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  39.32 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  40.51 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  40.51 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  37.95 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  39.9 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  39.41 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5642  peptidase M50  36.87 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.723367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  37.44 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  41.4 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  45.03 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1918  M50 family peptidase  37.21 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0658548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  38.35 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  43.13 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  40.87 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.87 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  38.81 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  40.8 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  37.38 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  40.21 
 
 		 220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  47.65 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  38.42 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  42.08 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1636  M50 family peptidase  36.63 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0323055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  42.08 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  41.21 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  46.47 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  39.47 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  42.13 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  41.24 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  39.81 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  37.62 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  35.71 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  44.78 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>