More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1390 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  48.78 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  48.33 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  59.21 
 
 		 165 aa  96.7  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  38.28 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  33.04 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  44.87 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.84 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  34.26 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  40.96 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  42.53 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  36.79 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  36.79 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  31.97 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  37.36 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  34.18 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 478 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08090  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.41 
 
 		 475 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000657612 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.5 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 477 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.11 
 
 		 490 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 459 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  31.43 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  38.89 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 477 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 477 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 477 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  44.29 
 
 		 477 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  36.25 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  27.48 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  42.39 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.75 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 500 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>