63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1389 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1389  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  100 
 
 		 68 aa  143  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000177278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  80.95 
 
 		 288 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  60.66 
 
 		 290 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  55.74 
 
 		 290 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  54.1 
 
 		 290 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  54.1 
 
 		 290 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 290 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 290 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 		 290 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 		 290 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 		 290 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  49.18 
 
 		 286 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 		 287 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  46.97 
 
 		 287 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  57.89 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  54.35 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  54.35 
 
 		 306 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  41.67 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  41.67 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  39.13 
 
 		 292 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0192  ABC transporter related  44.74 
 
 		 288 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  44.23 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  47.22 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  44.23 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2508  ABC transporter related  54.29 
 
 		 296 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  44.23 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 		 287 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  42.11 
 
 		 298 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  51.43 
 
 		 280 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  50 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  50 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  47.22 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  45.95 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  41.03 
 
 		 329 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  47.22 
 
 		 280 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 297 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  47.22 
 
 		 287 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  47.22 
 
 		 287 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  47.22 
 
 		 280 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  47.22 
 
 		 287 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  48.65 
 
 		 318 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  43.59 
 
 		 302 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 305 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  42.11 
 
 		 316 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  31.71 
 
 		 311 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  37.78 
 
 		 280 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  37.78 
 
 		 280 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  46.67 
 
 		 282 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.78 
 
 		 308 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>