183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1379 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1052 aa  2143    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  51.19 
 
 		 1882 aa  268  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1351 aa  238  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  44.33 
 
 		 395 aa  203  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.75 
 
 		 1842 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  33.03 
 
 		 1732 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  31.84 
 
 		 458 aa  167  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  34.58 
 
 		 460 aa  164  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  36.19 
 
 		 355 aa  162  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  34.62 
 
 		 1518 aa  159  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  41.82 
 
 		 456 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  34.32 
 
 		 399 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  37.15 
 
 		 2392 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  32.34 
 
 		 772 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.61 
 
 		 476 aa  137  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  30.52 
 
 		 730 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  34.98 
 
 		 352 aa  135  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1085 aa  129  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  33.47 
 
 		 995 aa  128  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.09 
 
 		 1266 aa  127  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  34.52 
 
 		 1088 aa  125  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  32.24 
 
 		 361 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  38.01 
 
 		 589 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1247 aa  115  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 789 aa  115  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 789 aa  115  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.77 
 
 		 531 aa  115  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  31.76 
 
 		 1070 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  31.76 
 
 		 1070 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  31.76 
 
 		 1112 aa  114  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  32.92 
 
 		 765 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  32.92 
 
 		 779 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  32.49 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  32.92 
 
 		 542 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  30 
 
 		 993 aa  112  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  25.85 
 
 		 766 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  32.64 
 
 		 766 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.5 
 
 		 760 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  32.64 
 
 		 755 aa  109  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  32.02 
 
 		 994 aa  109  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  32.08 
 
 		 760 aa  108  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.85 
 
 		 341 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  33.2 
 
 		 1012 aa  108  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  32.42 
 
 		 954 aa  107  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  25.97 
 
 		 421 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  34.56 
 
 		 347 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  31.94 
 
 		 1011 aa  101  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  28.27 
 
 		 643 aa  95.1  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  30.36 
 
 		 320 aa  94.7  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  33.87 
 
 		 285 aa  94.7  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  30.17 
 
 		 858 aa  93.6  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  32.21 
 
 		 237 aa  93.2  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.41 
 
 		 400 aa  92.8  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.98 
 
 		 2495 aa  92.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  27.91 
 
 		 467 aa  89.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  27.6 
 
 		 284 aa  89  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  27.24 
 
 		 279 aa  88.6  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  39.85 
 
 		 348 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  39.85 
 
 		 348 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  31.66 
 
 		 290 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  29.33 
 
 		 691 aa  87  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  27.99 
 
 		 718 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  27.1 
 
 		 498 aa  84.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  32.31 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  38.46 
 
 		 587 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  24.61 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.26 
 
 		 1015 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  26.84 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  35.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  33.2 
 
 		 293 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  28.57 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.58 
 
 		 1041 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1055 aa  77  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.15 
 
 		 863 aa  74.7  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  32.2 
 
 		 384 aa  73.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  44.44 
 
 		 269 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  37 
 
 		 297 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  27.14 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  36.87 
 
 		 937 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  30.71 
 
 		 482 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  41.35 
 
 		 203 aa  72  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  36.87 
 
 		 937 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  37.5 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  36.43 
 
 		 877 aa  71.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.22 
 
 		 508 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  28.51 
 
 		 374 aa  70.1  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  30.43 
 
 		 313 aa  70.1  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  27.75 
 
 		 657 aa  69.3  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  28.94 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.67 
 
 		 1107 aa  68.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  32.63 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  34.25 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  31.39 
 
 		 225 aa  66.6  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.64 
 
 		 867 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  29.41 
 
 		 1290 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  28.83 
 
 		 692 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.52 
 
 		 1263 aa  65.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  29.15 
 
 		 2031 aa  65.1  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  28.5 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  38.14 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>