241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1378 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  100 
 
 		 1030 aa  2073    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  60.26 
 
 		 1351 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  47.93 
 
 		 1750 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  48.13 
 
 		 850 aa  284  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  48.62 
 
 		 1763 aa  272  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  48.87 
 
 		 892 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  44.82 
 
 		 772 aa  248  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  42.66 
 
 		 1051 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  39.94 
 
 		 439 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  44.54 
 
 		 623 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  43.39 
 
 		 646 aa  227  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.84 
 
 		 963 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  43.61 
 
 		 2296 aa  210  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  38.92 
 
 		 2831 aa  194  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 		 863 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  33.89 
 
 		 425 aa  181  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 		 719 aa  181  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1026 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.51 
 
 		 1292 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.77 
 
 		 1130 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  35.01 
 
 		 831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 		 807 aa  164  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  36.34 
 
 		 2350 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  50.3 
 
 		 1140 aa  155  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  39.16 
 
 		 2961 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  39.93 
 
 		 1046 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 732 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  36.81 
 
 		 1916 aa  152  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.57 
 
 		 693 aa  151  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.79 
 
 		 676 aa  151  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 		 756 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  33.61 
 
 		 931 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  31.23 
 
 		 448 aa  145  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.29 
 
 		 930 aa  144  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 652 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.66 
 
 		 387 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  35.07 
 
 		 346 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  35.48 
 
 		 1567 aa  135  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  31.94 
 
 		 579 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.51 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.81 
 
 		 668 aa  128  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.88 
 
 		 627 aa  128  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 770 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  36.82 
 
 		 256 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  34.86 
 
 		 622 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  33.64 
 
 		 504 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  28.66 
 
 		 362 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  34.81 
 
 		 614 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.45 
 
 		 752 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.66 
 
 		 390 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  30.63 
 
 		 391 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.15 
 
 		 1079 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 2082 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  30.5 
 
 		 510 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  28.85 
 
 		 805 aa  115  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.15 
 
 		 841 aa  114  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  31.49 
 
 		 359 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  42.26 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1030 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  29.9 
 
 		 386 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.49 
 
 		 493 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  31.48 
 
 		 1140 aa  108  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  30.27 
 
 		 487 aa  107  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  36.49 
 
 		 1146 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.91 
 
 		 588 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.94 
 
 		 930 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  27.98 
 
 		 498 aa  105  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.4 
 
 		 1293 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.44 
 
 		 1163 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.79 
 
 		 709 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45750  predicted protein  35.62 
 
 		 262 aa  101  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  29.22 
 
 		 3320 aa  101  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33498  predicted protein  39.78 
 
 		 187 aa  99  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.77 
 
 		 343 aa  99  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  26.54 
 
 		 581 aa  98.6  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.75 
 
 		 491 aa  96.3  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.76 
 
 		 460 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40038  predicted protein  33.33 
 
 		 214 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0610628  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  28.01 
 
 		 1675 aa  92.8  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.66 
 
 		 307 aa  92.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  33.83 
 
 		 359 aa  91.3  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  37.57 
 
 		 446 aa  89.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25.94 
 
 		 353 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  28.27 
 
 		 404 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  31.82 
 
 		 674 aa  86.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  28.33 
 
 		 694 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  29.32 
 
 		 672 aa  86.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  25.18 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.08 
 
 		 786 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  24.54 
 
 		 372 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.5 
 
 		 525 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.82 
 
 		 985 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  29.6 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  39.29 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  28.72 
 
 		 470 aa  77.4  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.49 
 
 		 447 aa  77.4  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1177 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.58 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.99 
 
 		 612 aa  75.1  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>