112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1358 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  658    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  56.69 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  48.16 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  35.1 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  32.5 
 
 		 491 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  34.04 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  29.79 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  34.3 
 
 		 435 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  34.32 
 
 		 474 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  31.38 
 
 		 436 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  30.88 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  34.12 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  34.57 
 
 		 453 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  39.33 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  33.66 
 
 		 503 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  30.53 
 
 		 439 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  37.5 
 
 		 481 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  40.85 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  38.03 
 
 		 248 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  41.27 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  35.44 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  37.24 
 
 		 600 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  32.07 
 
 		 467 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  28.99 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  37.98 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  35.76 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  32.32 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  32.32 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  32.32 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  32.32 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  32.32 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  32.26 
 
 		 420 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  32.47 
 
 		 420 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  32.47 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  36.77 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  33.54 
 
 		 420 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  33.54 
 
 		 420 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  34.48 
 
 		 591 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  35.17 
 
 		 420 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  30.62 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  36.23 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  28.81 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  28.81 
 
 		 518 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  37.12 
 
 		 781 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  36.96 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  36.23 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  34.09 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  36.23 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  37.29 
 
 		 480 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  33.56 
 
 		 279 aa  89  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  33.86 
 
 		 620 aa  89  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  25 
 
 		 489 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  33.1 
 
 		 393 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  36.84 
 
 		 580 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  25.85 
 
 		 690 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  30.16 
 
 		 580 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  25 
 
 		 633 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  29.35 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  24.09 
 
 		 594 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  30.71 
 
 		 636 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  31.51 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  29.56 
 
 		 748 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  29.23 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  25.34 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  26.85 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  25.78 
 
 		 675 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  30.11 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  31.76 
 
 		 591 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  25.12 
 
 		 576 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  24.89 
 
 		 670 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  32.19 
 
 		 579 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  30.17 
 
 		 569 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  27.04 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  33.82 
 
 		 565 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  23.67 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  30.25 
 
 		 642 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  27.33 
 
 		 682 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  32.74 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  28.19 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  26.57 
 
 		 765 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  24.02 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  26.52 
 
 		 1016 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  31.53 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0598  VanW family protein  33.06 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  30.36 
 
 		 559 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  24.08 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  28.16 
 
 		 847 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  27.4 
 
 		 776 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  32.46 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  26.92 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  31.97 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  27.65 
 
 		 1355 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>