55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1351 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  100 
 
 
269 aa  540  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  65.4 
 
 
269 aa  351  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  58.11 
 
 
274 aa  335  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  56.32 
 
 
273 aa  291  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  50.19 
 
 
273 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  48.85 
 
 
278 aa  241  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  44.23 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  48.11 
 
 
288 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  46.39 
 
 
278 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  46.39 
 
 
275 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  47.67 
 
 
280 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  44.06 
 
 
284 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  45.95 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  38.78 
 
 
284 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  39.77 
 
 
274 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  38.26 
 
 
293 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  36.94 
 
 
297 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  40.08 
 
 
327 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  35.77 
 
 
287 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  35.77 
 
 
287 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  37.02 
 
 
287 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  35.88 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  35.71 
 
 
328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  35 
 
 
294 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  36.02 
 
 
289 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  34.6 
 
 
291 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  34.78 
 
 
279 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  33.21 
 
 
289 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  29.86 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  28.62 
 
 
611 aa  99  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  30.4 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  28.46 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  30.71 
 
 
458 aa  86.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  31.29 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  28.97 
 
 
587 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  29.2 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  27.31 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  28.72 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  26.74 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  29.41 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  29.1 
 
 
418 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  28.09 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  32.32 
 
 
348 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  28.21 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  27.32 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3283  putative peptidase  32.84 
 
 
338 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2840  cyanophycinase-like protein  32.84 
 
 
338 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  30.05 
 
 
234 aa  52.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  25.57 
 
 
229 aa  52.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  23.64 
 
 
559 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  22.41 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3909  putative peptidase  23.27 
 
 
217 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  21.82 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  21.82 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  25 
 
 
374 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>