291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1260 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 1184 aa  2391    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  44.15 
 
 		 935 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  46.17 
 
 		 1756 aa  345  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  41.77 
 
 		 867 aa  96.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  40.95 
 
 		 552 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  33.74 
 
 		 396 aa  90.9  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 631 aa  90.1  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  30.61 
 
 		 880 aa  89.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  30.25 
 
 		 693 aa  89.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 939 aa  89.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.41 
 
 		 688 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  38.46 
 
 		 546 aa  87.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.33 
 
 		 447 aa  87  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.39 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 604 aa  84  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  32.18 
 
 		 914 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  35.95 
 
 		 932 aa  83.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  32.42 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  28.26 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.08 
 
 		 926 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  30.38 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.45 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30 
 
 		 2313 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  27.75 
 
 		 1226 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.2 
 
 		 1821 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  32.26 
 
 		 819 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1260 aa  79.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  33.92 
 
 		 859 aa  78.2  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 640 aa  77.4  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.03 
 
 		 4630 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  32.86 
 
 		 733 aa  77  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  36.43 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  29.44 
 
 		 282 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 		 1029 aa  76.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  34.33 
 
 		 413 aa  76.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  28.34 
 
 		 758 aa  76.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  33.15 
 
 		 863 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.96 
 
 		 3027 aa  76.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  34.81 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.91 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.91 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.91 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  35.92 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.91 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  30 
 
 		 625 aa  75.5  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  31.4 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  35 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  35 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  31.62 
 
 		 506 aa  74.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  30.1 
 
 		 1847 aa  74.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  36.73 
 
 		 710 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  38.62 
 
 		 410 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  34.43 
 
 		 548 aa  73.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2497  hypothetical protein  61.7 
 
 		 81 aa  73.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  29.55 
 
 		 530 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  29.54 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  30.39 
 
 		 693 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  31.48 
 
 		 920 aa  72.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.54 
 
 		 1016 aa  72.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  30.99 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  32.69 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 1710 aa  72.4  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1194 aa  72  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  31.4 
 
 		 1168 aa  72  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  28.83 
 
 		 286 aa  72  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  31.49 
 
 		 410 aa  72  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  33.54 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 1321 aa  71.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.45 
 
 		 1174 aa  70.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  32.56 
 
 		 861 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  25.27 
 
 		 1009 aa  71.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.56 
 
 		 529 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  29.82 
 
 		 538 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  33.93 
 
 		 685 aa  70.1  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  32 
 
 		 862 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.38 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  32 
 
 		 862 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0748  hypothetical protein  37.01 
 
 		 388 aa  70.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  30.77 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  27.4 
 
 		 1081 aa  69.3  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  28.22 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  30.38 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  31.62 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  33.71 
 
 		 669 aa  69.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.76 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  29.41 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.11 
 
 		 1231 aa  68.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.38 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.38 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  26.23 
 
 		 921 aa  68.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  28.96 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 223 aa  67.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.38 
 
 		 529 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.67 
 
 		 526 aa  67.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.8 
 
 		 1661 aa  67.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1054  S-layer-like region  28.25 
 
 		 422 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  28.44 
 
 		 527 aa  67  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  27.93 
 
 		 360 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1252  putative S-layer protein  30 
 
 		 341 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>