More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1257 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  857    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  43.31 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  42.2 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  42.09 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  42.09 
 
 		 412 aa  310  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  40.88 
 
 		 413 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  40.67 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  40.46 
 
 		 411 aa  293  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  39.27 
 
 		 415 aa  292  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  40.62 
 
 		 420 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  42.27 
 
 		 413 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  41.03 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  39.38 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  37.38 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  40.49 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  38.83 
 
 		 420 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  44.63 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.47 
 
 		 411 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 		 413 aa  279  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  40.91 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  40.62 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  41.35 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 		 412 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  39.81 
 
 		 416 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  39.66 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  35.59 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  39.41 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  38.59 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  38.75 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  37.05 
 
 		 418 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  38.08 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  38.35 
 
 		 412 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  37.8 
 
 		 416 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  37.53 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  39.66 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  39.95 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  38.11 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.45 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  38.11 
 
 		 412 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  38.11 
 
 		 412 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  38.11 
 
 		 412 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.11 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.11 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  35.89 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  38.01 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  36.39 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  36.43 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  33.98 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  36.39 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  37.14 
 
 		 412 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  39.12 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  38.61 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  36.83 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  37.97 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  36.52 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  36.83 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  36.59 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  41.32 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  37.47 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  35.94 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  36.59 
 
 		 425 aa  246  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  36.43 
 
 		 424 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.1 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4216  competence/damage-inducible protein CinA  36.19 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4127  competence/damage-inducible protein CinA  36.19 
 
 		 424 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 424 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  35.94 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  37.75 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  37.2 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  34.62 
 
 		 408 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.05 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  35.77 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  35.45 
 
 		 443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  32.93 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  34.78 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  35.05 
 
 		 413 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  37.83 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.97 
 
 		 424 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  36.57 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  35.21 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  35.37 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  36.23 
 
 		 415 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  35.36 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.15 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  35.9 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  35.43 
 
 		 410 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  36.3 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  32.21 
 
 		 415 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  34.07 
 
 		 401 aa  219  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33.17 
 
 		 408 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  34 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.22 
 
 		 430 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.68 
 
 		 429 aa  215  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  34.27 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  34.27 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  34.27 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>