152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1216 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  594  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  34.88 
 
 
323 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  35.71 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
288 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  33.6 
 
 
284 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  32.45 
 
 
299 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  31.5 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  27.95 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.89 
 
 
294 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  27.14 
 
 
268 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  30.11 
 
 
283 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  32.76 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.19 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.15 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  33.73 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  25.44 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.33 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  22.41 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  28.05 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  30.73 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25.55 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  23.76 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.91 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  29.41 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  25.68 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  32.03 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  31.85 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  31.22 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  23.79 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.74 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  27.23 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  28.85 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  29.03 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.33 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  27.64 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  25.63 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  28.12 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  28.57 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  27.85 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  27.85 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  28.63 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  29.3 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  26.11 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  26.03 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  25.63 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  25.51 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  26.12 
 
 
240 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  27.75 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  26.42 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  28.17 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28.18 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  26.76 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  23.98 
 
 
265 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.27 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  25.63 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  21.37 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  26.47 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  27.22 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  29.73 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  26.94 
 
 
263 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
252 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
274 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  23.74 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  32 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.05 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  24.17 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.53 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.15 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  46.94 
 
 
239 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  46.94 
 
 
239 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  35.23 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  46.94 
 
 
239 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
266 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.02 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  27.89 
 
 
378 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.99 
 
 
232 aa  46.2  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.23 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  48.98 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>