More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1206 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  335  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  53.7 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 165 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  48.77 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  50.62 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  170  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 165 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  48.77 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  47.53 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  48.75 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  47.44 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  35.19 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  36.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  35.26 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  34.57 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  33.54 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  31.65 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  27.46 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.94 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.34 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  24.32 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  27.74 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  26.14 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  24.32 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  26.53 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  26.62 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.47 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  30.88 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>