More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1170 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 365 aa  734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  62.15 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  59.83 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  58.06 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  57.94 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  57.53 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  56.99 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  57.3 
 
 		 368 aa  418  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  59.39 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  59.73 
 
 		 370 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  56.91 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  56.58 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  55.71 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  53.33 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  55 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  51.25 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  54.29 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  52.79 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  51.51 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  54.95 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  51.21 
 
 		 368 aa  345  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  52.49 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  52.71 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  53.22 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  51.92 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  52.49 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  51.27 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  51.94 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  50.68 
 
 		 372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  50.14 
 
 		 372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  52.51 
 
 		 341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  51.37 
 
 		 363 aa  335  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  49.45 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  52.19 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  48.88 
 
 		 362 aa  325  9e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  50.88 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  50.29 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  49.85 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  49.05 
 
 		 369 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  52.05 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 		 342 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  51.17 
 
 		 342 aa  322  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  51.47 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  51.31 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  49.3 
 
 		 343 aa  318  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  50.44 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  47.92 
 
 		 365 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  49.15 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  49.15 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  49.15 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  49.04 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  47.61 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  49.86 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  46.88 
 
 		 340 aa  312  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  47.22 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  46.94 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.33 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 372 aa  309  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  48.7 
 
 		 343 aa  309  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  50.29 
 
 		 345 aa  308  6.999999999999999e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  48.27 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  51.23 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  51.23 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  44.95 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.02 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  49.56 
 
 		 342 aa  295  9e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  44.72 
 
 		 341 aa  292  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  48.67 
 
 		 341 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  48.68 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  48.54 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  47.95 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  44.77 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  46.29 
 
 		 339 aa  283  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  50.29 
 
 		 351 aa  281  9e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  47.56 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  45.7 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.82 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  43.85 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  42.64 
 
 		 390 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  43.68 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  39.61 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  40.64 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  42.6 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  40.9 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  43.39 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  42.23 
 
 		 319 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  38.76 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  38.76 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  39.04 
 
 		 319 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  38.76 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  38.76 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  38.76 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 320 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  39.61 
 
 		 319 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 320 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 320 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>