278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1162 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 
183 aa  378  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  39.56 
 
 
331 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  40.44 
 
 
194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  34.81 
 
 
307 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  34.24 
 
 
201 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 
228 aa  98.2  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1252  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.52 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  29.34 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  30.59 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2498  putative acyl-CoA thioesterase  27.93 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  29.07 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  27.33 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  28.41 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  33.33 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  27.91 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  28.49 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  31.61 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  28.82 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  26.29 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  29.94 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  28.83 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.86 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  28.74 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  29.19 
 
 
252 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.86 
 
 
216 aa  67  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  31.25 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  30 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  28.24 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  30.11 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  26.86 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  28.81 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  30.54 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.59 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  27.44 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  30.59 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  29.55 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  28.16 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  30.22 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  28.16 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  25.9 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  28.24 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2424  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.94 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  30 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.17 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  30.41 
 
 
275 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  30 
 
 
204 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  26.16 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  28.65 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  27.01 
 
 
255 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  27.59 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  28.14 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  30.59 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  30.41 
 
 
275 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2204  acyl-CoA thioesterase, putative  26.92 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  30.59 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  28.14 
 
 
225 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  27.59 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  27.59 
 
 
226 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  30.41 
 
 
286 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  27.59 
 
 
226 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  29.55 
 
 
204 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  27.59 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  25.7 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  30.99 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  27.01 
 
 
232 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  28.57 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  27.43 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  23.43 
 
 
219 aa  61.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0206  lipolytic protein G-D-S-L family  27.81 
 
 
173 aa  61.6  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  26.59 
 
 
255 aa  61.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  33.03 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  28.17 
 
 
215 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  28.17 
 
 
215 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  26.4 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  28 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  28.14 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  26.83 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  28.65 
 
 
223 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  26.9 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  24.56 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  28.09 
 
 
214 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  29.14 
 
 
266 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  27.49 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  26.79 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  27.01 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  30.95 
 
 
439 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02304  lipase/acylhydrolase, GDSL family protein  26.22 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  25.31 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  25.15 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  34.91 
 
 
202 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.67 
 
 
239 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  30.32 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2308  GDSL family lipase/acylhydrolase  26.46 
 
 
206 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  24.39 
 
 
206 aa  57.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  33.96 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  30.51 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  27.84 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>