More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1152 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  47.97 
 
 
692 aa  665  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  50.58 
 
 
694 aa  669  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.22 
 
 
692 aa  721  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  47.71 
 
 
696 aa  663  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  50.29 
 
 
695 aa  710  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  47.48 
 
 
696 aa  665  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  56.98 
 
 
670 aa  786  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.74 
 
 
690 aa  635  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  49.2 
 
 
696 aa  703  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  56.78 
 
 
673 aa  773  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  55.29 
 
 
667 aa  783  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  46.45 
 
 
692 aa  645  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  49.57 
 
 
694 aa  691  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  62.63 
 
 
680 aa  853  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  49.42 
 
 
697 aa  693  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  46.22 
 
 
689 aa  642  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.11404e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  53.72 
 
 
679 aa  735  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  55.12 
 
 
673 aa  761  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  49.86 
 
 
697 aa  691  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  46.97 
 
 
701 aa  679  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  46.83 
 
 
694 aa  674  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  49.86 
 
 
697 aa  703  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  47.54 
 
 
701 aa  676  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  50.73 
 
 
691 aa  692  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  45.76 
 
 
691 aa  649  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  47.91 
 
 
694 aa  669  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.76436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  100 
 
 
682 aa  1388  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.72853e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  47.62 
 
 
695 aa  674  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  45.65 
 
 
692 aa  635  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  45.76 
 
 
692 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  44.83 
 
 
691 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  45.51 
 
 
691 aa  631  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  46.77 
 
 
683 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  46.19 
 
 
690 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  45.16 
 
 
692 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  45.18 
 
 
692 aa  626  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  44.95 
 
 
691 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  46.72 
 
 
691 aa  628  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  44.31 
 
 
691 aa  623  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  45.12 
 
 
689 aa  623  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  47.51 
 
 
683 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  44.66 
 
 
691 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  44.8 
 
 
691 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  44.64 
 
 
692 aa  618  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.23332e-20 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  44.74 
 
 
691 aa  622  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  47.3 
 
 
682 aa  619  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  45.26 
 
 
691 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  44.72 
 
 
692 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  47.08 
 
 
686 aa  618  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  43.54 
 
 
697 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  44.67 
 
 
692 aa  618  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.39049e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  44.07 
 
 
691 aa  616  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  2.60019e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  43.69 
 
 
697 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  43.53 
 
 
693 aa  617  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  44.51 
 
 
697 aa  617  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  45.97 
 
 
696 aa  615  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  43.69 
 
 
697 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  44.3 
 
 
692 aa  615  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  44.38 
 
 
691 aa  615  1e-174  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  44.38 
 
 
691 aa  615  1e-174  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  44.66 
 
 
688 aa  613  1e-174  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  45.35 
 
 
692 aa  615  1e-174  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  43.71 
 
 
692 aa  615  1e-174  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  45.93 
 
 
692 aa  612  1e-174  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.29 
 
 
689 aa  613  1e-174  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.03 
 
 
696 aa  615  1e-174  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.37892e-05  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  44.57 
 
 
697 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.25345e-06  unclonable  1.75981e-07 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.44 
 
 
691 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  45.74 
 
 
691 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  2.19808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  43.67 
 
 
692 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  45.45 
 
 
692 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.24117e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  43.59 
 
 
697 aa  606  1e-172  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  44.61 
 
 
697 aa  607  1e-172  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  45.11 
 
 
689 aa  607  1e-172  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  44.49 
 
 
691 aa  605  1e-172  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  44.01 
 
 
692 aa  604  1e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  44.44 
 
 
697 aa  602  1e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.53268e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  43.57 
 
 
692 aa  604  1e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.05392e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.13 
 
 
692 aa  604  1e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  1.71204e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  42.92 
 
 
699 aa  602  1e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  43.04 
 
 
698 aa  603  1e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  42.92 
 
 
699 aa  602  1e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  44.24 
 
 
698 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  7.23027e-08 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  44.28 
 
 
692 aa  601  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  601  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  43.88 
 
 
698 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  3.55615e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.47757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.10071e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  43.87 
 
 
694 aa  598  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  43.06 
 
 
701 aa  601  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.92838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  45.29 
 
 
691 aa  599  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.61111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  43.84 
 
 
692 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.09677e-07  unclonable  1.50309e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  43.99 
 
 
692 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  41.69 
 
 
699 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  43.84 
 
 
692 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  41.69 
 
 
699 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  43.95 
 
 
698 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.60004e-06  hitchhiker  1.4201e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>