More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1132 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  100 
 
 
681 aa  1397  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.71 
 
 
957 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.35 
 
 
929 aa  350  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.73 
 
 
921 aa  347  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.04 
 
 
921 aa  347  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.33 
 
 
927 aa  336  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.39 
 
 
944 aa  333  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.27 
 
 
956 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.64 
 
 
952 aa  328  2e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.04 
 
 
960 aa  327  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  30.59 
 
 
838 aa  323  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  31.34 
 
 
822 aa  321  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.28 
 
 
934 aa  320  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.97 
 
 
876 aa  317  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  30.14 
 
 
840 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  30.4 
 
 
832 aa  310  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  30.41 
 
 
843 aa  307  4e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.77416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  29.09 
 
 
709 aa  303  5e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  29.9 
 
 
851 aa  302  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.66591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  30.59 
 
 
843 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  29.69 
 
 
643 aa  284  4e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  30.5 
 
 
707 aa  283  5e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  29.44 
 
 
636 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  29.77 
 
 
667 aa  281  3e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  30.73 
 
 
636 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  28.96 
 
 
646 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.39 
 
 
636 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  30.39 
 
 
636 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  30.39 
 
 
636 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  30.39 
 
 
636 aa  276  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  30.39 
 
 
636 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  30.39 
 
 
636 aa  276  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  29.79 
 
 
659 aa  276  1e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  30.39 
 
 
636 aa  276  1e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  30.11 
 
 
639 aa  276  1e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  29.55 
 
 
639 aa  275  2e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  28.44 
 
 
743 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  30.24 
 
 
636 aa  273  8e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  28.99 
 
 
660 aa  272  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.4 
 
 
978 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.62 
 
 
929 aa  271  3e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  29.99 
 
 
634 aa  271  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  29.11 
 
 
635 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  28.59 
 
 
631 aa  270  6e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  29.94 
 
 
636 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  29.94 
 
 
636 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  29.94 
 
 
636 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  27.72 
 
 
729 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  29.79 
 
 
636 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  29.44 
 
 
646 aa  268  3e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  27.72 
 
 
646 aa  268  3e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  28.72 
 
 
636 aa  268  3e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  29.77 
 
 
636 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  29.79 
 
 
636 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  30.17 
 
 
646 aa  266  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  30.15 
 
 
644 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  28.62 
 
 
633 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  29.76 
 
 
634 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  27.45 
 
 
754 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  29.33 
 
 
661 aa  265  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  9.73223e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  29.73 
 
 
634 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.92 
 
 
662 aa  265  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  29.73 
 
 
653 aa  265  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  29.76 
 
 
634 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  29.24 
 
 
651 aa  264  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.73 
 
 
652 aa  264  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  28.62 
 
 
633 aa  264  5e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.64 
 
 
652 aa  263  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  28.92 
 
 
713 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  29.89 
 
 
757 aa  261  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  3.48035e-07 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  28.95 
 
 
674 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  29.45 
 
 
647 aa  260  5e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.36 
 
 
674 aa  259  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  29.46 
 
 
649 aa  259  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  29.47 
 
 
651 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  30.21 
 
 
659 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.21 
 
 
659 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  29.54 
 
 
751 aa  258  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  28.78 
 
 
650 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  28.25 
 
 
725 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  29.53 
 
 
664 aa  257  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  27.68 
 
 
725 aa  257  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  29.51 
 
 
755 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  2.63353e-10 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  28.57 
 
 
647 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  28.46 
 
 
641 aa  256  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  28.46 
 
 
641 aa  256  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  28.59 
 
 
650 aa  256  1e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  29.55 
 
 
749 aa  255  2e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  30.02 
 
 
629 aa  255  2e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  29.05 
 
 
639 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 
966 aa  253  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  1.16759e-05  hitchhiker  6.48685e-10 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  28.85 
 
 
641 aa  253  9e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  28.36 
 
 
645 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  28.81 
 
 
645 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  29.31 
 
 
641 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  29.41 
 
 
633 aa  251  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  29.14 
 
 
698 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  28.61 
 
 
669 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  28.53 
 
 
755 aa  250  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  28.19 
 
 
658 aa  250  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>