More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1043 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  100 
 
 
754 aa  1535  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  37.23 
 
 
932 aa  326  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  41.48 
 
 
1168 aa  130  1e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  38.42 
 
 
1174 aa  128  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2679  hypothetical protein  45.05 
 
 
234 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  41.1 
 
 
288 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1458  hypothetical protein  45.37 
 
 
252 aa  115  4e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.53 
 
 
1009 aa  110  9e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0560  hypothetical protein  47.22 
 
 
243 aa  110  9e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.962196  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  38.55 
 
 
1847 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  36.41 
 
 
223 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  35.83 
 
 
935 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  36.9 
 
 
1710 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  35.52 
 
 
926 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  32.47 
 
 
692 aa  101  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  35.39 
 
 
1226 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.95 
 
 
506 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  33.17 
 
 
1821 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.68 
 
 
1016 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.02 
 
 
1013 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.37 
 
 
693 aa  98.6  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.05 
 
 
995 aa  98.2  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  34.83 
 
 
1081 aa  94.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  31.89 
 
 
1042 aa  94.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.3 
 
 
1054 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  31.63 
 
 
552 aa  91.3  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  31.02 
 
 
625 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  28.8 
 
 
4630 aa  88.6  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  32.24 
 
 
573 aa  87.8  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  31.55 
 
 
629 aa  87.8  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  30.69 
 
 
548 aa  87  1e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  32.43 
 
 
756 aa  86.7  1e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  32.8 
 
 
820 aa  86.7  2e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  33.72 
 
 
920 aa  86.7  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  27.4 
 
 
524 aa  85.5  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  32.52 
 
 
531 aa  85.1  4e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  28.41 
 
 
506 aa  84.7  5e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  34.41 
 
 
685 aa  85.1  5e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.04 
 
 
631 aa  84.3  7e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.89 
 
 
6885 aa  83.6  1e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  32.18 
 
 
758 aa  82.8  2e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 
1321 aa  82.4  3e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  32.52 
 
 
1194 aa  82.4  3e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.15 
 
 
1495 aa  82.4  3e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.09 
 
 
1328 aa  81.6  5e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  29.41 
 
 
431 aa  81.6  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  29.41 
 
 
594 aa  80.9  8e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.47431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  27.42 
 
 
710 aa  80.5  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  42.39 
 
 
921 aa  79.3  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.37339e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  32.87 
 
 
631 aa  79.3  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  31.28 
 
 
546 aa  79.3  2e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  29.73 
 
 
618 aa  78.2  5e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 
1029 aa  78.2  5e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  32 
 
 
767 aa  78.2  6e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1054  S-layer-like region  29.23 
 
 
422 aa  77.4  1e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 
657 aa  77  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  27.96 
 
 
2207 aa  76.3  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.11 
 
 
1234 aa  76.6  2e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  3.68528e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.28 
 
 
1661 aa  76.3  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  28.57 
 
 
1260 aa  76.3  2e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0748  hypothetical protein  26.21 
 
 
388 aa  75.5  3e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  35.45 
 
 
1208 aa  75.9  3e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  31.9 
 
 
1223 aa  75.1  4e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  31.76 
 
 
2286 aa  75.1  4e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  28.42 
 
 
554 aa  75.1  5e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  29.57 
 
 
729 aa  75.1  5e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.0624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.46 
 
 
447 aa  75.1  5e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  34.34 
 
 
620 aa  73.9  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  33.54 
 
 
620 aa  72.8  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40229e-08  hitchhiker  1.0382e-13 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  31.67 
 
 
413 aa  72.8  2e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  28.48 
 
 
526 aa  73.2  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  27 
 
 
693 aa  73.2  2e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  29.79 
 
 
218 aa  72.8  2e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  33.54 
 
 
620 aa  72.4  3e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  30 
 
 
360 aa  72.4  3e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  30.65 
 
 
733 aa  72.4  3e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.43 
 
 
3027 aa  72.4  3e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  35.05 
 
 
935 aa  72.4  3e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.16 
 
 
688 aa  71.6  5e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  30.57 
 
 
660 aa  71.2  7e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.40636e-07  hitchhiker  3.60107e-07 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  30.46 
 
 
360 aa  70.9  9e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  29.57 
 
 
2375 aa  70.1  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  26.57 
 
 
548 aa  69.3  2e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  35.94 
 
 
458 aa  69.3  2e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.03 
 
 
572 aa  69.3  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  28.65 
 
 
2178 aa  69.7  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  29.95 
 
 
609 aa  69.3  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  30.43 
 
 
857 aa  68.9  3e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  28.26 
 
 
413 aa  68.6  4e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.62 
 
 
567 aa  68.6  4e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  29.89 
 
 
360 aa  68.2  5e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.22253e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  29.89 
 
 
360 aa  68.2  5e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  5.41964e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  29.89 
 
 
360 aa  68.6  5e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  29.89 
 
 
360 aa  68.2  5e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  28.81 
 
 
518 aa  68.2  6e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  28.8 
 
 
414 aa  67.8  7e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.56 
 
 
567 aa  67.8  8e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2251e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  30.22 
 
 
669 aa  67.8  8e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  28.95 
 
 
1756 aa  67  1e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  29.1 
 
 
575 aa  66.2  2e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>