20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1036 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  610  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  36.64 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  36.18 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  32.75 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  32.99 
 
 		 296 aa  172  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  34.27 
 
 		 434 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  33.22 
 
 		 423 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  33.22 
 
 		 424 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  31.94 
 
 		 428 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  24.19 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  25.64 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  22.83 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  24.57 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  23.25 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  23.25 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  21.94 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  22.33 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2454  hypothetical protein  23.56 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000139037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  21.29 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  22.22 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>